論文の概要: Longitudinal patient stratification of electronic health records with
flexible adjustment for clinical outcomes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.06152v1
- Date: Thu, 11 Nov 2021 11:21:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-12 14:32:22.132985
- Title: Longitudinal patient stratification of electronic health records with
flexible adjustment for clinical outcomes
- Title(参考訳): 臨床結果に対するフレキシブル調整による電子健康記録の経時的成層化
- Authors: Oliver Carr, Avelino Javer, Patrick Rockenschaub, Owen Parsons, Robert
D\"urichen
- Abstract要約: 我々は、再構成、結果、クラスタリング損失を用いて、ERHデータをクラスタリングするリカレントニューラルネットワークオートエンコーダを開発する。
糖尿病患者29,229ドルの患者を対象に,異なる軌跡と異なる結果の患者集団のモデル性能を実証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7874708385247353
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The increase in availability of longitudinal electronic health record (EHR)
data is leading to improved understanding of diseases and discovery of novel
phenotypes. The majority of clustering algorithms focus only on patient
trajectories, yet patients with similar trajectories may have different
outcomes. Finding subgroups of patients with different trajectories and
outcomes can guide future drug development and improve recruitment to clinical
trials. We develop a recurrent neural network autoencoder to cluster EHR data
using reconstruction, outcome, and clustering losses which can be weighted to
find different types of patient clusters. We show our model is able to discover
known clusters from both data biases and outcome differences, outperforming
baseline models. We demonstrate the model performance on $29,229$ diabetes
patients, showing it finds clusters of patients with both different
trajectories and different outcomes which can be utilized to aid clinical
decision making.
- Abstract(参考訳): 縦断的電子健康記録(EHR)データの利用率の増加は、疾患の理解の向上と新しい表現型の発見につながっている。
クラスタリングアルゴリズムの大半は患者軌跡のみに焦点を当てているが、類似した軌跡を持つ患者は異なる結果をもたらす可能性がある。
軌跡や結果の異なる患者のサブグループを見つけることは、将来の薬物開発を導き、臨床試験への採用を改善することができる。
我々は、再建、結果、クラスタリング損失を用いて、ERHデータをクラスタリングするための繰り返しニューラルネットワークオートエンコーダを開発し、異なるタイプの患者クラスタを見つけるために重み付けできる。
我々のモデルは、データバイアスと結果差の両方から既知のクラスタを発見でき、ベースラインモデルより優れています。
我々は,29,229ドルの糖尿病患者に対するモデル性能を実証し,臨床的意思決定の助けとなりうる,軌跡の異なる患者群と結果の異なる患者群を見出した。
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