論文の概要: Unifying Heterogenous Electronic Health Records Systems via Text-Based
Code Embedding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.09098v1
- Date: Fri, 12 Nov 2021 20:27:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-21 14:31:27.342262
- Title: Unifying Heterogenous Electronic Health Records Systems via Text-Based
Code Embedding
- Title(参考訳): テキストベースコード埋め込みによる異種電子健康記録システムの統合
- Authors: Kyunghoon Hur, Jiyoung Lee, Jungwoo Oh, Wesley Price, Young-Hak Kim,
Edward Choi
- Abstract要約: EHRのためのコードに依存しない表現学習フレームワークであるDescription-based Embedding,DescEmbを紹介する。
DescEmbは、それぞれのイベントを直接専用の埋め込みにマッピングするのではなく、テキストのデクリプションを使用して臨床イベントを埋め込むニューラルネットワーク理解モデルの柔軟性を活用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.3394352452936085
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: EHR systems lack a unified code system forrepresenting medical concepts,
which acts asa barrier for the deployment of deep learningmodels in large scale
to multiple clinics and hos-pitals. To overcome this problem, we
introduceDescription-based Embedding,DescEmb, a code-agnostic representation
learning framework forEHR. DescEmb takes advantage of the flexibil-ity of
neural language understanding models toembed clinical events using their
textual descrip-tions rather than directly mapping each event toa dedicated
embedding. DescEmb outperformedtraditional code-based embedding in
extensiveexperiments, especially in a zero-shot transfertask (one hospital to
another), and was able totrain a single unified model for heterogeneousEHR
datasets.
- Abstract(参考訳): EHRシステムには、医療概念を規定する統一的なコードシステムがなく、複数のクリニックや病院にディープラーニングモデルを大規模に展開するための障壁として機能する。
この問題を解決するために,コードに依存しないEHR表現学習フレームワークであるDescription-based Embedding,DescEmbを紹介した。
descembは、各イベントを専用の埋め込みに直接マッピングするのではなく、テキストによる記述を使用して臨床イベントを組み込んだ神経言語理解モデルの柔軟性を活用する。
DescEmbは、大規模な実験、特にゼロショットトランスファータスク(ひとつの病院から別の病院へ)における従来のコードベースの埋め込みよりも優れており、異種EHRデータセットに対して単一の統一モデルをトレーニングすることができた。
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