論文の概要: Overcoming the Domain Gap in Contrastive Learning of Neural Action
Representations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.14595v1
- Date: Mon, 29 Nov 2021 15:27:51 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-30 17:38:03.574932
- Title: Overcoming the Domain Gap in Contrastive Learning of Neural Action
Representations
- Title(参考訳): 神経行動表現の対比学習における領域ギャップの克服
- Authors: Semih G\"unel and Florian Aymanns and Sina Honari and Pavan Ramdya and
Pascal Fua
- Abstract要約: 神経科学の基本的な目標は、神経活動と行動の関係を理解することである。
我々は,ハエが自然に生み出す行動からなる新しいマルチモーダルデータセットを作成した。
このデータセットと新しい拡張セットは、神経科学における自己教師あり学習手法の適用を加速することを約束します。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 60.47807856873544
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: A fundamental goal in neuroscience is to understand the relationship between
neural activity and behavior. For example, the ability to extract behavioral
intentions from neural data, or neural decoding, is critical for developing
effective brain machine interfaces. Although simple linear models have been
applied to this challenge, they cannot identify important non-linear
relationships. Thus, a self-supervised means of identifying non-linear
relationships between neural dynamics and behavior, in order to compute neural
representations, remains an important open problem. To address this challenge,
we generated a new multimodal dataset consisting of the spontaneous behaviors
generated by fruit flies, Drosophila melanogaster -- a popular model organism
in neuroscience research. The dataset includes 3D markerless motion capture
data from six camera views of the animal generating spontaneous actions, as
well as synchronously acquired two-photon microscope images capturing the
activity of descending neuron populations that are thought to drive actions.
Standard contrastive learning and unsupervised domain adaptation techniques
struggle to learn neural action representations (embeddings computed from the
neural data describing action labels) due to large inter-animal differences in
both neural and behavioral modalities. To overcome this deficiency, we
developed simple yet effective augmentations that close the inter-animal domain
gap, allowing us to extract behaviorally relevant, yet domain agnostic,
information from neural data. This multimodal dataset and our new set of
augmentations promise to accelerate the application of self-supervised learning
methods in neuroscience.
- Abstract(参考訳): 神経科学の基本的な目標は、神経活動と行動の関係を理解することである。
例えば、神経データや神経デコードから行動意図を抽出する能力は、効果的な脳機械インターフェイスを開発する上で重要である。
単純な線形モデルはこの問題に応用されてきたが、重要な非線形関係を特定できない。
このように、神経動力学と行動の間の非線形関係を同定する自己教師付き手段は、神経表現を計算するために重要な未解決問題である。
この課題に対処するために,キイロショウジョウバエが生成する自発的な行動からなる,ニューロサイエンス研究で人気のあるモデル生物であるキイロショウジョウバエ(drosophila melanogaster)のマルチモーダルデータセットを作成した。
このデータセットには、動物が自発的に行動を起こす6つのカメラビューからの3Dマーカーレスモーションキャプチャーデータと、行動を起こすと考えられる下降ニューロンの活動を撮影する2光子顕微鏡画像が含まれる。
標準のコントラスト学習と教師なしドメイン適応技術は、神経と行動のモダリティに大きな動物間差があるため、神経行動表現(行動ラベルを記述する神経データから計算された埋め込み)を学ぶのに苦労している。
この欠損を克服するため、動物間ドメインギャップを塞ぐシンプルで効果的な拡張法を開発し、神経データから行動に関連があるがドメインに依存しない情報を抽出した。
このマルチモーダルデータセットと新しい拡張セットは、神経科学における自己教師あり学習手法の適用を加速することを約束します。
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