論文の概要: Application of Markov Structure of Genomes to Outlier Identification and
Read Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.13117v1
- Date: Fri, 24 Dec 2021 18:03:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-29 12:09:26.560041
- Title: Application of Markov Structure of Genomes to Outlier Identification and
Read Classification
- Title(参考訳): ゲノムのマルコフ構造の異常識別と読み出し分類への応用
- Authors: Alan F. Karr, Jason Hauzel, Adam A. Porter, Marcel Schaefer
- Abstract要約: 本研究では,ゲノムの構造を2つのバイオインフォマティクス問題に応用する。
我々は、実際のウイルスとアデノウイルスのデータを用いて、ゲノムデータベースの異常値を特定し、メダゲノミクスの分類を読み取る。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.22940141855172028
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In this paper we apply the structure of genomes as second-order Markov
processes specified by the distributions of successive triplets of bases to two
bioinformatics problems: identification of outliers in genome databases and
read classification in metagenomics, using real coronavirus and adenovirus
data.
- Abstract(参考訳): 本稿では,2つのバイオインフォマティクス問題,すなわち,ゲノムデータベースにおける異常点の同定と,実際のウイルスとアデノウイルスのデータを用いたメダゲノミクスにおける分類の2次マルコフ過程として,ゲノムの構造を応用する。
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