論文の概要: Infant Brain Age Classification: 2D CNN Outperforms 3D CNN in Small
Dataset
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.13811v1
- Date: Mon, 27 Dec 2021 18:02:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-28 16:22:29.999127
- Title: Infant Brain Age Classification: 2D CNN Outperforms 3D CNN in Small
Dataset
- Title(参考訳): 乳幼児の脳年齢分類:2D CNNは小データセットで3D CNNより優れている
- Authors: Mahdieh Shabanian, Markus Wenzel, John P. DeVincenzo
- Abstract要約: 乳児の脳磁気共鳴画像(MRI)は、ミエリン化以外の特定の発達パターンを示す。
標準化された基準がなければ、3歳前のMRIから脳の構造的成熟度を視覚的に推定することは、サーバ間およびサーバ内変動によって支配される。
我々は、この課題に取り組むための一般的な実現可能性と、2次元および3次元畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を含む様々なアプローチの有用性について検討する。
中央軸厚スラブ上に2次元CNNを用いて0.90[95% CI:0.86-0.94]の精度を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.14063138455565613
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Determining if the brain is developing normally is a key component of
pediatric neuroradiology and neurology. Brain magnetic resonance imaging (MRI)
of infants demonstrates a specific pattern of development beyond simply
myelination. While radiologists have used myelination patterns, brain
morphology and size characteristics to determine age-adequate brain maturity,
this requires years of experience in pediatric neuroradiology. With no
standardized criteria, visual estimation of the structural maturity of the
brain from MRI before three years of age remains dominated by inter-observer
and intra-observer variability. A more objective estimation of brain
developmental age could help physicians identify many neurodevelopmental
conditions and diseases earlier and more reliably. Such data, however, is
naturally hard to obtain, and the observer ground truth not much of a gold
standard due to subjectivity of assessment. In this light, we explore the
general feasibility to tackle this task, and the utility of different
approaches, including two- and three-dimensional convolutional neural networks
(CNN) that were trained on a fusion of T1-weighted, T2-weighted, and proton
density (PD) weighted sequences from 84 individual subjects divided into four
age groups from birth to 3 years of age. In the best performing approach, we
achieved an accuracy of 0.90 [95% CI:0.86-0.94] using a 2D CNN on a central
axial thick slab. We discuss the comparison to 3D networks and show how the
performance compares to the use of only one sequence (T1w). In conclusion,
despite the theoretical superiority of 3D CNN approaches, in limited-data
situations, such approaches are inferior to simpler architectures. The code can
be found in https://github.com/shabanian2018/Age_MRI-Classification
- Abstract(参考訳): 脳が正常に発達しているかどうかを決定することは、小児神経放射線学と神経学の重要な要素である。
乳児の脳磁気共鳴画像(MRI)は、単純なミエリン化以上の発達パターンを示す。
放射線学者は、ミエリン化パターン、脳形態、大きさの特徴を年齢に合った脳の成熟度を決定するために用いているが、これは小児神経放射線学における長年の経験を必要とする。
標準的な基準がないため、3歳以前のmriから脳の構造成熟度を視覚的に推定することは、オブザーバ間およびオブザーバ内変動によって支配されている。
より客観的な脳発達年齢の推定は、医師がより早くより確実に多くの神経発達状態や疾患を特定するのに役立つ。
しかし、そのようなデータを得るのは自然に困難であり、観察者は評価の主観性のために金本位制の真理をあまり持っていない。
本研究では,t1重み付き,t2重み付き,およびプロトン密度 (pd) の融合を訓練した2次元および3次元畳み込みニューラルネットワーク (cnn) を,出生から3歳までの4つの年齢グループに分けた84名の被験者の重み付きシーケンスに適用する。
中央軸厚スラブ上に2次元CNNを用いて0.90[95% CI:0.86-0.94]の精度を実現した。
本稿では,3次元ネットワークとの比較を行い,その性能を1つのシーケンス(T1w)で比較した。
結論として、3D CNNアプローチの理論的優位性にもかかわらず、限られたデータ状況では、そのようなアプローチはより単純なアーキテクチャよりも劣っている。
コードはhttps://github.com/shabanian2018/Age_MRI-Classificationにある。
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