論文の概要: H\&E-adversarial network: a convolutional neural network to learn
stain-invariant features through Hematoxylin \& Eosin regression
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.06329v1
- Date: Mon, 17 Jan 2022 10:34:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-01-19 17:48:09.444170
- Title: H\&E-adversarial network: a convolutional neural network to learn
stain-invariant features through Hematoxylin \& Eosin regression
- Title(参考訳): h\&e-adversarial network: hematoxylin \& eosin regression による染色不変特徴学習のための畳み込みニューラルネットワーク
- Authors: Niccol\'o Marini, Manfredo Atzori, Sebastian Ot\'alora, Stephane
Marchand-Maillet, Henning M\"uller
- Abstract要約: 本稿では,様々な色の変化を含むデータに基づいて,畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を学習する新しい手法を提案する。
H&E-adversarial CNNと呼ばれるこの手法は、トレーニング中にH&Eマトリックス情報を利用して、染色不変の特徴を学習する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7371375427784381
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Computational pathology is a domain that aims to develop algorithms to
automatically analyze large digitized histopathology images, called whole slide
images (WSI). WSIs are produced scanning thin tissue samples that are stained
to make specific structures visible. They show stain colour heterogeneity due
to different preparation and scanning settings applied across medical centers.
Stain colour heterogeneity is a problem to train convolutional neural networks
(CNN), the state-of-the-art algorithms for most computational pathology tasks,
since CNNs usually underperform when tested on images including different stain
variations than those within data used to train the CNN. Despite several
methods that were developed, stain colour heterogeneity is still an unsolved
challenge that limits the development of CNNs that can generalize on data from
several medical centers. This paper aims to present a novel method to train
CNNs that better generalize on data including several colour variations. The
method, called H\&E-adversarial CNN, exploits H\&E matrix information to learn
stain-invariant features during the training. The method is evaluated on the
classification of colon and prostate histopathology images, involving eleven
heterogeneous datasets, and compared with five other techniques used to handle
stain colour heterogeneity. H\&E-adversarial CNNs show an improvement in
performance compared to the other algorithms, demonstrating that it can help to
better deal with stain colour heterogeneous images.
- Abstract(参考訳): コンピュータ病理学(Computational pathology)は、スライド画像全体 (WSI) と呼ばれる大規模なデジタル組織像を自動的に解析するアルゴリズムを開発することを目的とした分野である。
WSIは、特定の構造を可視化するために染色された薄い組織サンプルを走査する。
医療センター間で異なる準備とスキャン設定により、染色色の不均一性を示す。
色の不均一性は、ほとんどの計算病理タスクの最先端アルゴリズムである畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を訓練する問題である。
いくつかの方法が開発されているにもかかわらず、染色色の不均一性は、いくつかの医療センターのデータに基づいて一般化できるCNNの開発を制限する未解決の課題である。
本稿では,複数の色変化を含むデータをより一般化するcnnの訓練手法を提案する。
この方法はh\&e-adversarial cnnと呼ばれ、h\&eマトリクス情報を利用してトレーニング中に染色不変の特徴を学ぶ。
この方法は,11種類の異種データセットを含む大腸および前立腺病理画像の分類において評価され,染色色多様性を扱うために用いられる他の5つの手法と比較された。
H\&E-adversarial CNNは、他のアルゴリズムと比較して性能が向上し、色の不均一な画像に対処するのに役立つことを示した。
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