論文の概要: Retroformer: Pushing the Limits of Interpretable End-to-end Retrosynthesis Transformer

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.12475v1
• Date: Sat, 29 Jan 2022 02:03:55 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-02-01 17:56:27.000542
• Title: Retroformer: Pushing the Limits of Interpretable End-to-end Retrosynthesis Transformer
• Title（参考訳）: retroformer: 解釈可能なエンドツーエンドのレトロトランスフォーメーショントランスフォーマの限界を押し上げる
• Authors: Yue Wan, Benben Liao, Chang-Yu Hsieh, Shengyu Zhang
• Abstract要約: 再合成予測は有機合成の基本的な課題の1つである。 本稿では,レトロシンセシス予測のためのトランスフォーマーに基づく新しいアーキテクチャであるRetroformerを提案する。 Retroformerは、エンドツーエンドのテンプレートフリーレトロシンセシスのための新しい最先端の精度に達する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 15.722719721123054
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
• Abstract: Retrosynthesis prediction is one of the fundamental challenges in organic synthesis. The task is to predict the reactants given a core product. With the advancement of machine learning, computer-aided synthesis planning has gained increasing interest. Numerous methods were proposed to solve this problem with different levels of dependency on additional chemical knowledge. In this paper, we propose Retroformer, a novel Transformer-based architecture for retrosynthesis prediction without relying on any cheminformatics tools for molecule editing. Via the proposed local attention head, the model can jointly encode the molecular sequence and graph, and efficiently exchange information between the local reactive region and the global reaction context. Retroformer reaches the new state-of-the-art accuracy for the end-to-end template-free retrosynthesis, and improves over many strong baselines on better molecule and reaction validity. In addition, its generative procedure is highly interpretable and controllable. Overall, Retroformer pushes the limits of the reaction reasoning ability of deep generative models.
• Abstract（参考訳）: 再合成予測は有機合成の基本的な課題の1つである。 タスクは、コア製品に与えられた反応物質を予測することです。 機械学習の進歩により、コンピュータ支援合成計画への関心が高まっている。 この問題を解決するために様々な手法が提案され、追加の化学知識に依存する。 本稿では,分子編集のための化学計算ツールを使わずに,レトロシンセシス予測のためのトランスフォーマーベースの新しいアーキテクチャであるRetroformerを提案する。 提案する局所注意ヘッドにより, 分子配列とグラフを共同でエンコードし, 局所反応性領域と大域的反応コンテキスト間の情報交換を効率的に行うことができる。 retroformerは、エンドツーエンドのテンプレートフリーなレトロシンセシスの新しい最先端精度に達し、より優れた分子と反応の有効性に関する多くの強力なベースラインを改善している。 さらに、その生成過程は高度に解釈可能で制御可能である。 全体として、Retroformerは、深い生成モデルの反応推論能力の限界を押し上げる。

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