論文の概要: Hyperbolic Neural Networks for Molecular Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.12825v1
- Date: Sun, 30 Jan 2022 14:14:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-02-01 15:12:10.759298
- Title: Hyperbolic Neural Networks for Molecular Generation
- Title(参考訳): 分子生成のための双曲型ニューラルネットワーク
- Authors: Eric Qu, Dongmian Zou
- Abstract要約: 多くの深層発生器は分子グラフから原子関係を抽出し、原子レベルと分子レベルの階層情報を無視する。
このような階層的な情報を抽出するために,我々は新しい双曲的生成モデルを提案する。
本モデルでは, 潜在双曲空間に分子の階層的情報を埋め込む完全双曲型ジャンクションツリーエンコーダデコーダと, 潜曲型エンコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデコーダデオーダデオーダデコーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデアンドデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダデオーダ
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.061135251278187
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: With the recent advance of deep learning, neural networks have been
extensively used for the task of molecular generation. Many deep generators
extract atomic relations from molecular graphs and ignore hierarchical
information at both atom and molecule levels. In order to extract such
hierarchical information, we propose a novel hyperbolic generative model. Our
model contains three parts: first, a fully hyperbolic junction-tree
encoder-decoder that embeds the hierarchical information of the molecules in
the latent hyperbolic space; second, a latent generative adversarial network
for generating the latent embeddings; third, a molecular generator that
inherits the decoders from the first part and the latent generator from the
second part. We evaluate our model on the ZINC dataset using the MOSES
benchmarking platform and achieve competitive results, especially in metrics
about structural similarity.
- Abstract(参考訳): 近年のディープラーニングの進歩により、ニューラルネットワークは分子生成のタスクに広く利用されている。
多くの深層発生器は分子グラフから原子関係を抽出し、原子レベルと分子レベルの階層情報を無視する。
そこで,このような階層情報を抽出するために,新しい双曲生成モデルを提案する。
第1に、潜在性双曲空間に分子の階層情報を埋め込む完全双曲型ジャンクション・ツリー・エンコーダ・デコーダ、第2に潜在性埋め込みを生成する潜在性生成逆ネットワーク、第3に第1部分からデコーダを継承する分子発生器、第2部分から潜在性発生器である。
MOSESベンチマークプラットフォームを用いてZINCデータセット上でモデルを評価し、特に構造的類似性に関する指標において、競合的な結果を得る。
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