論文の概要: A novel shape-based loss function for machine learning-based seminal
organ segmentation in medical imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.03336v1
- Date: Mon, 7 Mar 2022 12:26:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-08 18:35:20.586679
- Title: A novel shape-based loss function for machine learning-based seminal
organ segmentation in medical imaging
- Title(参考訳): 医用画像における機械学習に基づく精器官分割のための新しい形状的損失関数
- Authors: Reza Karimzadeh, Emad Fatemizadeh, Hossein Arabi
- Abstract要約: 深部畳み込みニューラルネットワークは、正確かつ自動セミナルセグメンテーションにおいて有望な性能を示した。
ネットワークが基礎となる形状の特徴を学習・把握することを奨励・抑制する,新しい形状に基づくコスト関数を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0312968200748116
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automated medical image segmentation is an essential task to aid/speed up
diagnosis and treatment procedures in clinical practices. Deep convolutional
neural networks have exhibited promising performance in accurate and automatic
seminal segmentation. For segmentation tasks, these methods normally rely on
minimizing a cost/loss function that is designed to maximize the overlap
between the estimated target and the ground-truth mask delineated by the
experts. A simple loss function based on the degrees of overlap (i.e., Dice
metric) would not take into account the underlying shape and morphology of the
target subject, as well as its realistic/natural variations; therefore,
suboptimal segmentation results would be observed in the form of islands of
voxels, holes, and unrealistic shapes or deformations. In this light, many
studies have been conducted to refine/post-process the segmentation outcome and
consider an initial guess as prior knowledge to avoid outliers and/or
unrealistic estimations. In this study, a novel shape-based cost function is
proposed which encourages/constrains the network to learn/capture the
underlying shape features in order to generate a valid/realistic estimation of
the target structure. To this end, the Principal Component Analysis (PCA) was
performed on a vectorized training dataset to extract eigenvalues and
eigenvectors of the target subjects. The key idea was to use the reconstruction
weights to discriminate valid outcomes from outliers/erroneous estimations.
- Abstract(参考訳): 医療画像の自動分割は臨床における診断と治療の迅速化に欠かせない課題である。
深部畳み込みニューラルネットワークは、正確かつ自動セミナルセグメンテーションにおいて有望な性能を示した。
セグメンテーションのタスクでは、これらの手法は通常、推定目標と専門家によって規定された地道マスクとの重なりを最大化するために設計されたコスト/損失関数を最小化する。
重なりの程度(すなわちサイス計量)に基づく単純な損失関数は、対象対象の基本的な形状や形態や現実的・自然な変化を考慮に入れず、ボクセル、穴、非現実的な形状や変形といった形で準最適セグメンテーションの結果が観察される。
この観点から、セグメンテーションの結果を精錬/後処理し、初期推測を、外れ値や非現実的な推定を避けるための事前知識として考える多くの研究がなされている。
そこで本研究では,ネットワークが対象構造の有効かつ現実的な推定を行うために,基礎となる形状特徴の学習/取得を奨励する新たな形状ベースコスト関数を提案する。
そこで,ベクトル化学習データセット上で主成分分析(pca)を行い,対象者の固有値と固有ベクトルを抽出する。
鍵となるアイデアは、リコンストラクションの重みを使って、外れ値/誤推定から正当な結果を判別することであった。
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