論文の概要: KenMeSH: Knowledge-enhanced End-to-end Biomedical Text Labelling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.06835v1
- Date: Mon, 14 Mar 2022 03:09:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-15 14:48:16.872148
- Title: KenMeSH: Knowledge-enhanced End-to-end Biomedical Text Labelling
- Title(参考訳): KenMeSH:知識に富んだエンドツーエンドのバイオメディカルテキストラベリング
- Authors: Xindi Wang, Robert E. Mercer, Frank Rudzicz
- Abstract要約: 現在、MeSH(Messical Subject Headings)は、PubMedデータベースに記録されたすべてのバイオメディカル記事に手動で割り当てられ、関連する情報の検索を容易にする。
我々は、新しいテキスト機能と動的textbfKnowledge-textbfenhancedマスクアテンションを組み合わせたエンドツーエンドモデルであるKenMeSHを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.321887243319924
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Currently, Medical Subject Headings (MeSH) are manually assigned to every
biomedical article published and subsequently recorded in the PubMed database
to facilitate retrieving relevant information. With the rapid growth of the
PubMed database, large-scale biomedical document indexing becomes increasingly
important. MeSH indexing is a challenging task for machine learning, as it
needs to assign multiple labels to each article from an extremely large
hierachically organized collection. To address this challenge, we propose
KenMeSH, an end-to-end model that combines new text features and a dynamic
\textbf{K}nowledge-\textbf{en}hanced mask attention that integrates document
features with MeSH label hierarchy and journal correlation features to index
MeSH terms. Experimental results show the proposed method achieves
state-of-the-art performance on a number of measures.
- Abstract(参考訳): 現在、MeSH(Messical Subject Headings)は、PubMedデータベースに記録されたすべてのバイオメディカル記事に手動で割り当てられ、関連する情報の検索を容易にする。
PubMedデータベースの急速な成長に伴い,大規模バイオメディカル文書インデックス作成の重要性が高まっている。
メッシュインデクシングは、非常に大規模な階層的なコレクションから各記事に複数のラベルを割り当てる必要があるため、マシンラーニングでは困難なタスクである。
この課題に対処するために、新しいテキスト機能と動的 \textbf{K}nowledge-\textbf{en}hanced mask attentionを組み合わせたエンドツーエンドモデルであるKenMeSHを提案する。
実験結果から, 提案手法は, 様々な測定結果に基づいて最先端の性能を実現する。
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