論文の概要: Simulation-Driven Training of Vision Transformers Enabling Metal
Segmentation in X-Ray Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.09207v1
- Date: Thu, 17 Mar 2022 09:58:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-18 16:01:09.162174
- Title: Simulation-Driven Training of Vision Transformers Enabling Metal
Segmentation in X-Ray Images
- Title(参考訳): X線画像における金属セグメンテーションを考慮した視覚変換器のシミュレーション駆動訓練
- Authors: Fuxin Fan, Ludwig Ritschl, Marcel Beister, Ramyar Biniazan, Bj\"orn
Kreher, Tristan M. Gottschalk, Steffen Kappler, Andreas Maier
- Abstract要約: 本研究は,CTデータセットとCADインプラントを組み合わせたシミュレーションX線画像を生成することを提案する。
CBCT射影における金属セグメンテーションは、金属アーティファクト回避および還元アルゴリズムの前提条件となる。
本研究は,CADモデルに基づくデータ生成の柔軟性が向上し,臨床データサンプリングとラベル付けの不足を克服する手段となる可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.416928579907334
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: In several image acquisition and processing steps of X-ray radiography,
knowledge of the existence of metal implants and their exact position is highly
beneficial (e.g. dose regulation, image contrast adjustment). Another
application which would benefit from an accurate metal segmentation is cone
beam computed tomography (CBCT) which is based on 2D X-ray projections. Due to
the high attenuation of metals, severe artifacts occur in the 3D X-ray
acquisitions. The metal segmentation in CBCT projections usually serves as a
prerequisite for metal artifact avoidance and reduction algorithms. Since the
generation of high quality clinical training is a constant challenge, this
study proposes to generate simulated X-ray images based on CT data sets
combined with self-designed computer aided design (CAD) implants and make use
of convolutional neural network (CNN) and vision transformer (ViT) for metal
segmentation. Model test is performed on accurately labeled X-ray test datasets
obtained from specimen scans. The CNN encoder-based network like U-Net has
limited performance on cadaver test data with an average dice score below 0.30,
while the metal segmentation transformer with dual decoder (MST-DD) shows high
robustness and generalization on the segmentation task, with an average dice
score of 0.90. Our study indicates that the CAD model-based data generation has
high flexibility and could be a way to overcome the problem of shortage in
clinical data sampling and labelling. Furthermore, the MST-DD approach
generates a more reliable neural network in case of training on simulated data.
- Abstract(参考訳): X線ラジオグラフィーのいくつかの画像取得および処理ステップでは、金属インプラントの存在とその正確な位置に関する知識は非常に有用である(線量調整、画像コントラスト調整など)。
正確な金属セグメンテーションの恩恵を受ける別の応用は、2次元X線投影に基づくコーンビーム計算トモグラフィー (CBCT) である。
金属の高減衰のため、3次元のX線取得で深刻なアーティファクトが発生する。
CBCT射影における金属セグメンテーションは、通常、金属アーティファクト回避および還元アルゴリズムの前提条件となる。
そこで本研究では,CTデータセットとCADインプラントを併用し,金属セグメンテーションのための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)と視覚変換器(ViT)を併用したシミュレーションX線画像を作成することを提案する。
検体スキャンから得られたx線検査データセットを精度良くラベル付けしてモデルテストを行う。
U-NetのようなCNNエンコーダベースのネットワークは、平均ダイススコアが0.30未満のケーダバー試験データに制限がある一方、デュアルデコーダ(MST-DD)による金属セグメンテーショントランスフォーマーは、セグメンテーションタスクにおいて高い堅牢性と一般化を示し、平均ダイススコアは0.90である。
本研究は,CADモデルに基づくデータ生成の柔軟性が向上し,臨床データサンプリングとラベル付けの不足を克服できる可能性を示している。
さらに、MST-DDアプローチは、シミュレーションデータのトレーニングを行う際に、より信頼性の高いニューラルネットワークを生成する。
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