論文の概要: Multi-View Substructure Learning for Drug-Drug Interaction Prediction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.14513v1
• Date: Mon, 28 Mar 2022 05:44:29 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-03-29 17:20:01.111894
• Title: Multi-View Substructure Learning for Drug-Drug Interaction Prediction
• Title（参考訳）: 薬物・薬物相互作用予測のための多視点サブ構造学習
• Authors: Zimeng Li, Shichao Zhu, Bin Shao, Tie-Yan Liu, Xiangxiang Zeng and Tong Wang
• Abstract要約: DDI予測のための新しいマルチビュードラッグサブ構造ネットワーク(MSN-DDI)を提案する。 MSN-DDIは、単一の薬物(イントラビュー)と薬物ペア(インタービュー)の両方の表現から化学的サブ構造を同時に学習し、そのサブ構造を利用して、薬物表現を反復的に更新する。 総合的な評価では、MSN-DDIは、トランスダクティブ・セッティングの下で比較的改善された19.32%と99%以上の精度を達成することで、既存の薬物に対するDDI予測をほぼ解決したことを示している。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 69.34322811160912
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Drug-drug interaction (DDI) prediction provides a drug combination strategy for systemically effective treatment. Previous studies usually model drug information constrained on a single view such as the drug itself, leading to incomplete and noisy information, which limits the accuracy of DDI prediction. In this work, we propose a novel multi- view drug substructure network for DDI prediction (MSN-DDI), which learns chemical substructures from both the representations of the single drug (intra-view) and the drug pair (inter-view) simultaneously and utilizes the substructures to update the drug representation iteratively. Comprehensive evaluations demonstrate that MSN-DDI has almost solved DDI prediction for existing drugs by achieving a relatively improved accuracy of 19.32% and an over 99% accuracy under the transductive setting. More importantly, MSN-DDI exhibits better generalization ability to unseen drugs with a relatively improved accuracy of 7.07% under more challenging inductive scenarios. Finally, MSN-DDI improves prediction performance for real-world DDI applications to new drugs.
• Abstract（参考訳）: 薬物と薬物の相互作用(DDI)予測は、体系的に有効な治療のための薬物の組み合わせ戦略を提供する。 先行研究は通常、薬物自体のような単一視点に制約された薬物情報をモデル化し、不完全でノイズの多い情報となり、DDI予測の精度が制限される。 本研究では,単剤 (intra-view) と対 (inter-view) の両方の表現から化学サブストラクチャーを学習し,そのサブストラクチャーを用いて反復的に薬物表現を更新するddi予測(msn-ddi)のための新しい多視点薬物サブストラクチャーネットワークを提案する。 総合的な評価では、MSN-DDIは、トランスダクティブ・セッティングの下で比較的改善された19.32%と99%以上の精度を達成することで、既存の薬物に対するDDI予測をほぼ解決したことを示している。 さらに重要なことは、MSN-DDIはより困難な誘導シナリオの下で、比較的改善された7.07%の精度で薬物を発見できるより良い一般化能力を示す。 最後に、MSN-DDIは、新しい薬物に対する現実世界のDDIアプリケーションの予測性能を改善する。

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