論文の概要: Improved Counting and Localization from Density Maps for Object
Detection in 2D and 3D Microscopy Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.15691v1
- Date: Tue, 29 Mar 2022 15:54:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-30 13:51:35.411471
- Title: Improved Counting and Localization from Density Maps for Object
Detection in 2D and 3D Microscopy Imaging
- Title(参考訳): 2次元・3次元顕微鏡像における物体検出のための密度マップからのカウントと位置推定の改善
- Authors: Shijie Li, Thomas Ach, Guido Gerig
- Abstract要約: 密度マップから対象をカウント・ローカライズする別の方法を提案する。
その結果,2次元および3次元顕微鏡データにおけるオブジェクトのカウントとローカライゼーションの性能が向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.746727774540763
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Object counting and localization are key steps for quantitative analysis in
large-scale microscopy applications. This procedure becomes challenging when
target objects are overlapping, are densely clustered, and/or present fuzzy
boundaries. Previous methods producing density maps based on deep learning have
reached a high level of accuracy for object counting by assuming that object
counting is equivalent to the integration of the density map. However, this
model fails when objects show significant overlap regarding accurate
localization. We propose an alternative method to count and localize objects
from the density map to overcome this limitation. Our procedure includes the
following three key aspects: 1) Proposing a new counting method based on the
statistical properties of the density map, 2) optimizing the counting results
for those objects which are well-detected based on the proposed counting
method, and 3) improving localization of poorly detected objects using the
proposed counting method as prior information. Validation includes processing
of microscopy data with known ground truth and comparison with other models
that use conventional processing of the density map. Our results show improved
performance in counting and localization of objects in 2D and 3D microscopy
data. Furthermore, the proposed method is generic, considering various
applications that rely on the density map approach. Our code will be released
post-review.
- Abstract(参考訳): オブジェクトのカウントとローカライゼーションは、大規模顕微鏡アプリケーションにおける定量分析の鍵となるステップである。
この手順は、ターゲットオブジェクトが重なり合ったり、密集したり、ファジィ境界が現在ある場合に困難になる。
これまでの深層学習に基づく密度マップ作成法は,オブジェクトカウントが密度マップの統合と等価であると仮定して,オブジェクトカウントの精度が高水準に達している。
しかし、このモデルは、オブジェクトが正確なローカライゼーションに関して大きな重複を示すときに失敗する。
この制限を克服するために、密度マップからオブジェクトを数えてローカライズする方法を提案する。
私たちの手順は以下の3つの重要な側面を含む。
1)密度マップの統計的性質に基づく新しい計数法の提案
2 提案した計数方法に基づいて検出された対象物の計数結果を最適化し、
3) 提案手法を先行情報として, 検出不良物体の局在性を改善する。
検証には、既知の基底真理を持つ顕微鏡データの処理と、従来の密度マップの処理を用いた他のモデルとの比較が含まれる。
その結果,2次元および3次元顕微鏡データにおけるオブジェクトのカウントとローカライゼーションの性能が向上した。
さらに,密度マップアプローチに依拠する各種応用を考えると,提案手法は汎用的である。
私たちのコードはレビュー後にリリースされます。
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