論文の概要: External control of a genetic toggle switch via Reinforcement Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.04972v1
- Date: Mon, 11 Apr 2022 09:41:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-12 18:57:41.432555
- Title: External control of a genetic toggle switch via Reinforcement Learning
- Title(参考訳): 強化学習による遺伝的トグルスイッチの外部制御
- Authors: Sara Maria Brancato, Francesco De Lellis, Davide Salzano, Giovanni
Russo, Mario di Bernardo
- Abstract要約: 本稿では,外部制御手法を用いて合成トグルスイッチを安定化させる学習戦略の問題点について検討する。
我々は、トグルスイッチの簡易なモデルによるトレーニングを通じてポリシーを学習するsim-to-realパラダイムを採用する。
本実験は,本手法が生体内制御の実装に有効であることを示すものであることを示すものである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6424021470496672
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We investigate the problem of using a learning-based strategy to stabilize a
synthetic toggle switch via an external control approach. To overcome the data
efficiency problem that would render the algorithm unfeasible for practical use
in synthetic biology, we adopt a sim-to-real paradigm where the policy is
learnt via training on a simplified model of the toggle switch and it is then
subsequently exploited to control a more realistic model of the switch
parameterized from in-vivo experiments. Our in-silico experiments confirm the
viability of the approach suggesting its potential use for in-vivo control
implementations.
- Abstract(参考訳): 本稿では,外部制御手法を用いて合成トグルスイッチを安定化させる学習戦略の問題点について検討する。
合成生物学におけるアルゴリズムの実用性を損なうデータ効率問題を克服するために,トグルスイッチの簡易モデル上でのトレーニングを通じてポリシを学習し,その後,生体内実験からパラメータ化されたスイッチのより現実的なモデルを制御するために,シム・トゥ・リアル・パラダイムを採用する。
当社の in-silico 実験では,in-vivo 制御実装の可能性を示唆するアプローチの有効性を確認した。
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