論文の概要: EndoMapper dataset of complete calibrated endoscopy procedures
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.14240v1
- Date: Fri, 29 Apr 2022 17:10:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-05-02 14:37:45.711537
- Title: EndoMapper dataset of complete calibrated endoscopy procedures
- Title(参考訳): 完全校正内視鏡のEndoMapperデータセット
- Authors: Pablo Azagra, Carlos Sostres, \'Angel Ferrandez, Luis Riazuelo, Clara
Tomasini, Oscar Le\'on Barbed, Javier Morlana, David Recasens, Victor M.
Batlle, Juan J. G\'omez-Rodr\'iguez, Richard Elvira, Julia L\'opez, Cristina
Oriol, Javier Civera, Juan D. Tard\'os, Ana Cristina Murillo, Angel Lanas and
Jos\'e M.M. Montiel
- Abstract要約: 本報告では,通常の診療で取得した内視鏡の完全配列の最初のコレクションであるEndomapperデータセットについて紹介する。
データは3Dマッピングとローカライゼーションシステムの構築に使用され、探索中に盲点を検出するなど、特別なタスクを実行できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.577980383972005
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Computer-assisted systems are becoming broadly used in medicine. In
endoscopy, most research focuses on automatic detection of polyps or other
pathologies, but localization and navigation of the endoscope is completely
performed manually by physicians. To broaden this research and bring spatial
Artificial Intelligence to endoscopies, data from complete procedures are
needed. This data will be used to build a 3D mapping and localization systems
that can perform special task like, for example, detect blind zones during
exploration, provide automatic polyp measurements, guide doctors to a polyp
found in a previous exploration and retrieve previous images of the same area
aligning them for easy comparison. These systems will provide an improvement in
the quality and precision of the procedures while lowering the burden on the
physicians. This paper introduces the Endomapper dataset, the first collection
of complete endoscopy sequences acquired during regular medical practice,
including slow and careful screening explorations, making secondary use of
medical data. Its original purpose is to facilitate the development and
evaluation of VSLAM (Visual Simultaneous Localization and Mapping) methods in
real endoscopy data. The first release of the dataset is composed of 59
sequences with more than 15 hours of video. It is also the first endoscopic
dataset that includes both the computed geometric and photometric endoscope
calibration with the original calibration videos. Meta-data and annotations
associated to the dataset varies from anatomical landmark and description of
the procedure labeling, tools segmentation masks, COLMAP 3D reconstructions,
simulated sequences with groundtruth and meta-data related to special cases,
such as sequences from the same patient. This information will improve the
research in endoscopic VSLAM, as well as other research lines, and create new
research lines.
- Abstract(参考訳): コンピュータ支援システムは医学で広く使われている。
内視鏡検査では,ポリープなどの病態の自動検出に焦点が当てられているが,内視鏡の局所化とナビゲーションは医師が手動で行う。
この研究を拡大し、空間人工知能を内科にもたらすためには、完全な手順からのデータが必要である。
このデータは、3Dマッピングとローカライゼーションシステムの構築に利用され、例えば、探索中の盲点検出、自動ポリープ測定、前回の探索で見つかったポリープへの医師の誘導、そしてそれらを比較しやすいように整列した同じ領域の以前の画像の検索などを行うことができる。
これらのシステムは、医師の負担を軽減しつつ、手順の質と精度を改善します。
本報告では, 経時的, 注意深い検診, 医用データの二次的利用を含む, 定期的な医療実践中に得られた内視鏡的完全配列の最初のコレクションであるEndomapperデータセットを紹介する。
元々の目的は、実内視鏡データにおけるvslam(visual concurrent localization and mapping)法の開発と評価を容易にすることである。
データセットの最初のリリースは15時間以上のビデオを含む59のシーケンスで構成されている。
これはまた、計算された幾何学的および測光的内視鏡の校正と元の校正ビデオの両方を含む最初の内視鏡的データセットである。
データセットに関連するメタデータとアノテーションは、解剖学的ランドマークやプロシージャラベリングの記述、ツールセグメンテーションマスク、colmap 3dリコンストラクション、同一患者からのシーケンスのような特別なケースに関連する基底とメタデータによるシミュレーションシーケンスなどによって異なる。
この情報は、内視鏡的vslamおよび他の研究ラインにおける研究を改善し、新しい研究ラインを作成する。
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