論文の概要: FINETUNA: Fine-tuning Accelerated Molecular Simulations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.01223v1
- Date: Mon, 2 May 2022 21:36:01 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-05-05 01:52:40.717667
- Title: FINETUNA: Fine-tuning Accelerated Molecular Simulations
- Title(参考訳): FINETUNA:微調整加速分子シミュレーション
- Authors: Joseph Musielewicz, Xiaoxiao Wang, Tian Tian, and Zachary Ulissi
- Abstract要約: 本稿では,原子系のシミュレーションを効率的かつ正確に高速化するためのオンライン能動的学習フレームワークを提案する。
事前学習されたモデルから事前情報を組み込む伝達学習法は、DFT計算の数を91%減らしてシミュレーションを加速する。
30個のベンチマーク吸着剤触媒系の実験により,事前学習したモデルから事前情報を組み込むトランスファー学習法がシミュレーションを加速し,DFT計算の数を91%削減した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.543169726358164
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Machine learning approaches have the potential to approximate Density
Functional Theory (DFT) for atomistic simulations in a computationally
efficient manner, which could dramatically increase the impact of computational
simulations on real-world problems. However, they are limited by their accuracy
and the cost of generating labeled data. Here, we present an online active
learning framework for accelerating the simulation of atomic systems
efficiently and accurately by incorporating prior physical information learned
by large-scale pre-trained graph neural network models from the Open Catalyst
Project. Accelerating these simulations enables useful data to be generated
more cheaply, allowing better models to be trained and more atomistic systems
to be screened. We also present a method of comparing local optimization
techniques on the basis of both their speed and accuracy. Experiments on 30
benchmark adsorbate-catalyst systems show that our method of transfer learning
to incorporate prior information from pre-trained models accelerates
simulations by reducing the number of DFT calculations by 91%, while meeting an
accuracy threshold of 0.02 eV 93% of the time. Finally, we demonstrate a
technique for leveraging the interactive functionality built in to VASP to
efficiently compute single point calculations within our online active learning
framework without the significant startup costs. This allows VASP to work in
tandem with our framework while requiring 75% fewer self-consistent cycles than
conventional single point calculations. The online active learning
implementation, and examples using the VASP interactive code, are available in
the open source FINETUNA package on Github.
- Abstract(参考訳): 機械学習のアプローチは、原子論的シミュレーションの近似密度汎関数理論(dft)を計算効率良く行う可能性を秘めており、実世界の問題に対する計算シミュレーションの影響を劇的に増加させる可能性がある。
しかし、それらの精度とラベル付きデータを生成するコストによって制限されている。
本稿では,open catalystプロジェクトから得られた大規模事前学習グラフニューラルネットワークモデルから得られた事前物理情報を取り入れることで,原子システムのシミュレーションを効率的に高精度に促進するオンラインアクティブラーニングフレームワークを提案する。
これらのシミュレーションを加速することにより、有用なデータがより安価に生成され、より良いモデルをトレーニングし、より原子系のスクリーニングが可能になる。
また,局所最適化手法を速度と精度の両方に基づいて比較する手法を提案する。
30のベンチマーク吸着触媒系を用いた実験により,事前学習したモデルから事前情報を組み込む変換学習法は,精度の0.02 eV 93%を満たすとともに,DFT計算数を91%削減し,シミュレーションを加速することがわかった。
最後に,vaspに組み込まれたインタラクティブな機能を活用して,オンラインアクティブラーニングフレームワーク内のシングルポイント計算を,スタートアップコストを伴わずに効率的に計算する手法を実証する。
これによってVASPは、従来の単一ポイント計算よりも75%少ない自己整合サイクルを必要としながら、私たちのフレームワークと連動して動作します。
VASPインタラクティブコードを使用したオンラインアクティブラーニングの実装と例は、GithubのオープンソースFINETUNAパッケージで公開されている。
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