論文の概要: So3krates -- Self-attention for higher-order geometric interactions on
arbitrary length-scales
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.14276v1
- Date: Sat, 28 May 2022 00:01:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-05 02:29:55.062187
- Title: So3krates -- Self-attention for higher-order geometric interactions on
arbitrary length-scales
- Title(参考訳): So3krates -- 任意の長さスケール上の高次幾何学的相互作用に対する自己注意
- Authors: J. Thorben Frank, Oliver T. Unke, Klaus-Robert M\"uller
- Abstract要約: 分子や物質の量子力学的性質は非局所電子効果に依存する。
この研究は、基礎となる物理学に適応した改良された注意機構を提案する。
提案したモデルであるSo3kratesは任意の長さスケールで非局所量子力学的効果を記述することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.1485350418225244
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The application of machine learning methods in quantum chemistry has enabled
the study of numerous chemical phenomena, which are computationally intractable
with traditional ab-initio methods. However, some quantum mechanical properties
of molecules and materials depend on non-local electronic effects, which are
often neglected due to the difficulty of modeling them efficiently. This work
proposes a modified attention mechanism adapted to the underlying physics,
which allows to recover the relevant non-local effects. Namely, we introduce
spherical harmonic coordinates (SPHCs) to reflect higher-order geometric
information for each atom in a molecule, enabling a non-local formulation of
attention in the SPHC space. Our proposed model So3krates -- a self-attention
based message passing neural network -- uncouples geometric information from
atomic features, making them independently amenable to attention mechanisms. We
show that in contrast to other published methods, So3krates is able to describe
non-local quantum mechanical effects over arbitrary length scales. Further, we
find evidence that the inclusion of higher-order geometric correlations
increases data efficiency and improves generalization. So3krates matches or
exceeds state-of-the-art performance on popular benchmarks, notably, requiring
a significantly lower number of parameters (0.25--0.4x) while at the same time
giving a substantial speedup (6--14x for training and 2--11x for inference)
compared to other models.
- Abstract(参考訳): 量子化学における機械学習法の適用により、従来のab-initio法では計算に難解な多数の化学現象の研究が可能となった。
しかし、分子や物質の量子力学的性質は非局所電子効果に依存しており、効率的なモデリングが困難であるためしばしば無視される。
本研究は、関連する非局所的効果を回復する基礎となる物理に適応した注意の修正機構を提案する。
球面調和座標(SPHC)を導入し、分子内の各原子の高次幾何学情報を反映し、SPHC空間における非局所的な注意の定式化を可能にする。
提案したモデルであるSo3krates – 自己注意に基づくメッセージパッシングニューラルネットワーク – は、原子的特徴から幾何学的情報を分離し、注意機構に独立して対応できるようにする。
他の公開手法とは対照的に、so3kratesは任意の長さスケール上の非局所量子力学的効果を記述することができる。
さらに,高次幾何相関の包含によりデータ効率が向上し,一般化が向上することを示す。
So3kratesは、一般的なベンチマークで最先端のパフォーマンスにマッチまたは超え、特にパラメータ(0.25-0.4x)をかなり少なくし、同時にトレーニングで6-14x、推論で2-11x)を他のモデルと比較する。
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