論文の概要: DeepDefacer: Automatic Removal of Facial Features via U-Net Image
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.15536v1
- Date: Tue, 31 May 2022 04:51:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-01 13:58:49.379224
- Title: DeepDefacer: Automatic Removal of Facial Features via U-Net Image
Segmentation
- Title(参考訳): deepdefacer: u-netイメージセグメンテーションによる顔特徴の自動除去
- Authors: Anish Khazane, Julien Hoachuck, Krzysztof J. Gorgolewski, Russell A.
Poldrack
- Abstract要約: 我々は、ディープラーニングのMRI匿名化への応用であるDeepDefacerを紹介した。
DeepDefacerは、3D U-Netネットワークを使ってMRI画像の顔領域を隠蔽する。
我々は、脳開発機構(IXI)と国際脳地図コンソーシアム(ICBM)からMRI画像のDeepDefacerを訓練する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.22366638308792727
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Recent advancements in the field of magnetic resonance imaging (MRI) have
enabled large-scale collaboration among clinicians and researchers for
neuroimaging tasks. However, researchers are often forced to use outdated and
slow software to anonymize MRI images for publication. These programs
specifically perform expensive mathematical operations over 3D images that
rapidly slow down anonymization speed as an image's volume increases in size.
In this paper, we introduce DeepDefacer, an application of deep learning to MRI
anonymization that uses a streamlined 3D U-Net network to mask facial regions
in MRI images with a significant increase in speed over traditional
de-identification software. We train DeepDefacer on MRI images from the Brain
Development Organization (IXI) and International Consortium for Brain Mapping
(ICBM) and quantitatively evaluate our model against a baseline 3D U-Net model
with regards to Dice, recall, and precision scores. We also evaluate
DeepDefacer against Pydeface, a traditional defacing application, with regards
to speed on a range of CPU and GPU devices and qualitatively evaluate our
model's defaced output versus the ground truth images produced by Pydeface. We
provide a link to a PyPi program at the end of this manuscript to encourage
further research into the application of deep learning to MRI anonymization.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴イメージング(MRI)の分野での最近の進歩は、臨床医と研究者の間で大規模なコラボレーションを可能にしている。
しかし、研究者はしばしば、古い遅いソフトウェアを使って、出版のためにMRI画像の匿名化を迫られる。
これらのプログラムは特に3d画像上で高価な数学的操作を行い、画像のサイズが大きくなるにつれて匿名化速度を急速に遅くする。
本稿では,mri画像中の顔領域を高速にマスキングする3d u-netネットワークを用いた,ディープラーニングを用いたmri匿名化手法であるdeepdefacerについて紹介する。
我々は、脳開発機構(IXI)と国際脳マッピング機構(ICBM)からMRI画像のDeepDefacerをトレーニングし、Dice、リコール、精度スコアに関するベースライン3D U-Netモデルに対して、我々のモデルを定量的に評価する。
また,従来のデファクトアプリケーションであるpydefaceに対するdeepdefacerの評価を行い,cpuおよびgpuデバイスの速度について評価し,pydefaceが生成するグランド・トゥルート画像と比較して,モデルのデファクトアウトプットを質的に評価した。
我々は,この原稿の最後にPyPiプログラムへのリンクを提供し,深層学習のMRI匿名化への応用についてさらなる研究を奨励する。
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