論文の概要: GAN-based Super-Resolution and Segmentation of Retinal Layers in Optical
coherence tomography Scans
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.13740v1
- Date: Tue, 28 Jun 2022 03:53:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-02 15:08:23.665232
- Title: GAN-based Super-Resolution and Segmentation of Retinal Layers in Optical
coherence tomography Scans
- Title(参考訳): 光コヒーレンストモグラフィーにおけるGANによる網膜層の超解像とセグメンテーション
- Authors: Paria Jeihouni, Omid Dehzangi, Annahita Amireskandari, Ali Rezai,
Nasser M. Nasrabadi
- Abstract要約: 網膜層のCTスキャンの超高分解能化とセグメンテーションのためのGAN(Generative Adversarial Network)ベースのソリューションを提案する。
GANに基づくセグメンテーションモデルと、人気のあるネットワーク、すなわちU-NetとResNetをGANアーキテクチャに組み込んだ評価を行う。
我々の最良のモデル構成は、Dice係数 0.867 と mIOU 0.765 を実証的に達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.016298207860974
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In this paper, we design a Generative Adversarial Network (GAN)-based
solution for super-resolution and segmentation of optical coherence tomography
(OCT) scans of the retinal layers. OCT has been identified as a non-invasive
and inexpensive modality of imaging to discover potential biomarkers for the
diagnosis and progress determination of neurodegenerative diseases, such as
Alzheimer's Disease (AD). Current hypotheses presume the thickness of the
retinal layers, which are analyzable within OCT scans, can be effective
biomarkers. As a logical first step, this work concentrates on the challenging
task of retinal layer segmentation and also super-resolution for higher clarity
and accuracy. We propose a GAN-based segmentation model and evaluate
incorporating popular networks, namely, U-Net and ResNet, in the GAN
architecture with additional blocks of transposed convolution and sub-pixel
convolution for the task of upscaling OCT images from low to high resolution by
a factor of four. We also incorporate the Dice loss as an additional
reconstruction loss term to improve the performance of this joint optimization
task. Our best model configuration empirically achieved the Dice coefficient of
0.867 and mIOU of 0.765.
- Abstract(参考訳): 本稿では,網膜層の光コヒーレンストモグラフィー(OCT)スキャンの超高分解能化とセグメンテーションのためのGAN(Generative Adversarial Network)ベースのソリューションを設計する。
OCTは、アルツハイマー病(AD)などの神経変性疾患の診断と進行判定のための潜在的なバイオマーカーを発見するために、非侵襲的で安価な画像モダリティとして同定されている。
現在の仮説では、OCTスキャンで分析可能な網膜層の厚さが有効なバイオマーカーとなる。
論理的な第一歩として、この研究は網膜層セグメンテーションの挑戦的な課題に集中し、高明度と精度のために超高解像度化を行う。
本稿では,ganベースのセグメンテーションモデルを提案し,u-net と resnet という一般的なネットワークを gan アーキテクチャに組み込むことにより,低解像度から高解像度の oct イメージを4倍に拡大するタスクについて評価する。
また, この統合最適化タスクの性能を向上させるため, diceロスを追加の再構成損失項として取り入れた。
我々の最良のモデル構成は経験的に0.867のサイス係数と0.765のmiouを達成した。
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