論文の概要: Automated Prostate Cancer Diagnosis Based on Gleason Grading Using
Convolutional Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.14301v1
- Date: Sun, 29 Nov 2020 06:42:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-07 09:06:40.249442
- Title: Automated Prostate Cancer Diagnosis Based on Gleason Grading Using
Convolutional Neural Network
- Title(参考訳): 畳み込みニューラルネットワークを用いたグリアソン評価に基づく前立腺癌自動診断
- Authors: Haotian Xie, Yong Zhang, Jun Wang, Jingjing Zhang, Yifan Ma, Zhaogang
Yang
- Abstract要約: そこで本研究では,前立腺癌(PCa)の完全分類のための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いた自動分類法を提案する。
Patch-Based Image Reconstruction (PBIR) と呼ばれるデータ拡張手法が提案され,WSIの高分解能化と多様性の向上が図られた。
対象データセットへの事前学習モデルの適応性を高めるために,分布補正モジュールを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.161266795282915
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The Gleason grading system using histological images is the most powerful
diagnostic and prognostic predictor of prostate cancer. The current standard
inspection is evaluating Gleason H&E-stained histopathology images by
pathologists. However, it is complicated, time-consuming, and subject to
observers. Deep learning (DL) based-methods that automatically learn image
features and achieve higher generalization ability have attracted significant
attention. However, challenges remain especially using DL to train the whole
slide image (WSI), a predominant clinical source in the current diagnostic
setting, containing billions of pixels, morphological heterogeneity, and
artifacts. Hence, we proposed a convolutional neural network (CNN)-based
automatic classification method for accurate grading of PCa using whole slide
histopathology images. In this paper, a data augmentation method named
Patch-Based Image Reconstruction (PBIR) was proposed to reduce the high
resolution and increase the diversity of WSIs. In addition, a distribution
correction (DC) module was developed to enhance the adaption of pretrained
model to the target dataset by adjusting the data distribution. Besides, a
Quadratic Weighted Mean Square Error (QWMSE) function was presented to reduce
the misdiagnosis caused by equal Euclidean distances. Our experiments indicated
the combination of PBIR, DC, and QWMSE function was necessary for achieving
superior expert-level performance, leading to the best results (0.8885
quadratic-weighted kappa coefficient).
- Abstract(参考訳): 組織像を用いたGleason grading systemは前立腺癌の診断および予後予測の最も強力な方法である。
現在の標準検査は、病理学者によるGleason H&Eによる病理像の評価である。
しかし、それは複雑で、時間がかかり、観察対象となる。
画像特徴を自動的に学習し,高度な一般化能力を実現するディープラーニング(DL)ベースの手法が注目されている。
しかしながら、現在の診断における主要な臨床ソースであるスライド画像全体(WSI)のトレーニングには、数十億画素のピクセル、形態的不均一性、アーティファクトをDLで用い続けている。
そこで本研究では,PCaの精度向上のための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いた自動分類法を提案する。
本稿では,高分解能化とWSIの多様性向上のために,PBIR(Patch-Based Image Reconstruction)というデータ拡張手法を提案する。
さらに,データ分布を調整することにより,事前学習したモデルのターゲットデータセットへの適応性を高めるために,分布補正(DC)モジュールを開発した。
さらに, 重み付き平均角誤差(QWMSE)関数を提示し, ユークリッド距離による誤診を低減した。
実験の結果, pbir, dc, qwmse関数の組み合わせは, 優れたエキスパートレベル性能を達成するために必要であり, 最高の結果(0.8885倍重み付きkappa係数)をもたらした。
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