論文の概要: Context-aware Self-supervised Learning for Medical Images Using Graph
Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.02957v1
- Date: Wed, 6 Jul 2022 20:30:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-09 05:46:04.930641
- Title: Context-aware Self-supervised Learning for Medical Images Using Graph
Neural Network
- Title(参考訳): グラフニューラルネットワークを用いた医用画像の文脈対応自己教師付き学習
- Authors: Li Sun, Ke Yu, Kayhan Batmanghelich
- Abstract要約: 本稿では,2段階の自己指導型表現学習目標を用いた新しい手法を提案する。
グラフニューラルネットワークを用いて、異なる解剖学的領域間の関係を組み込む。
グラフの構造は、各患者と解剖学的アトラスの間の解剖学的対応によって通知される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 24.890564475121238
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Although self-supervised learning enables us to bootstrap the training by
exploiting unlabeled data, the generic self-supervised methods for natural
images do not sufficiently incorporate the context. For medical images, a
desirable method should be sensitive enough to detect deviation from
normal-appearing tissue of each anatomical region; here, anatomy is the
context. We introduce a novel approach with two levels of self-supervised
representation learning objectives: one on the regional anatomical level and
another on the patient-level. We use graph neural networks to incorporate the
relationship between different anatomical regions. The structure of the graph
is informed by anatomical correspondences between each patient and an
anatomical atlas. In addition, the graph representation has the advantage of
handling any arbitrarily sized image in full resolution. Experiments on
large-scale Computer Tomography (CT) datasets of lung images show that our
approach compares favorably to baseline methods that do not account for the
context. We use the learned embedding for staging lung tissue abnormalities
related to COVID-19.
- Abstract(参考訳): 自己教師付き学習は、ラベルのないデータを利用してトレーニングをブートストラップすることができるが、自然画像の汎用的な自己教師付き手法は、文脈を十分に取り入れていない。
医用画像の場合、解剖学的には各解剖学的領域の正常な組織からの偏差を検出するのに十分な感度が望ましい。
本稿では,地域解剖学レベルと患者レベルの2段階の自己指導型表現学習目標を用いた新しいアプローチを提案する。
グラフニューラルネットワークを用いて、異なる解剖学的領域間の関係を組み込む。
グラフの構造は、各患者と解剖学的アトラスの間の解剖学的対応によって通知される。
さらに、グラフ表現は任意の任意サイズの画像をフル解像度で処理する利点がある。
肺画像の大規模コンピュータ断層撮影(CT)データセットを用いた実験により,本手法は文脈を考慮しないベースライン法と比較した。
我々は、covid-19に関連する肺組織異常のステージングに、学習埋め込みを用いる。
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