論文の概要: Combining Hybrid Architecture and Pseudo-label for Semi-supervised
Abdominal Organ Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.11512v1
- Date: Sat, 23 Jul 2022 13:02:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-26 14:30:31.457339
- Title: Combining Hybrid Architecture and Pseudo-label for Semi-supervised
Abdominal Organ Segmentation
- Title(参考訳): 半教師付き腹部臓器セグメンテーションのためのハイブリッドアーキテクチャと擬似ラベルの併用
- Authors: Wentao Liu, Weijin Xu, Songlin Yan, Lemeng Wang, Huihua Yang, Haoyuan
Li
- Abstract要約: 本研究では,CNNとTransformerのハイブリッドアーキテクチャ(PHTrans)を教師モデルと学生モデルの両方に適用し,正確な擬似ラベルを生成する。
FLARE2022の検証実験により,提案手法は高速かつ低リソースなモデル推論だけでなく,セグメンテーション性能にも優れることを示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.392397691020232
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Abdominal organ segmentation has many important clinical applications, such
as organ quantification, surgical planning, and disease diagnosis. However,
manually annotating organs from CT scans is time-consuming and labor-intensive.
Semi-supervised learning has shown the potential to alleviate this challenge by
learning from a large set of unlabeled images and limited labeled samples. In
this work, we follow the self-training strategy and employ a hybrid
architecture (PHTrans) with CNN and Transformer for both teacher and student
models to generate precise pseudo-labels. Afterward, we introduce them with
label data together into a two-stage segmentation framework with lightweight
PHTrans for training to improve the performance and generalization ability of
the model while remaining efficient. Experiments on the validation set of
FLARE2022 demonstrate that our method achieves excellent segmentation
performance as well as fast and low-resource model inference. The average DSC
and HSD are 0.8956 and 0.9316, respectively. Under our development
environments, the average inference time is 18.62 s, the average maximum GPU
memory is 1995.04 MB, and the area under the GPU memory-time curve and the
average area under the CPU utilization-time curve are 23196.84 and 319.67.
- Abstract(参考訳): 腹部臓器セグメンテーションは、臓器定量化、手術計画、疾患診断など、多くの重要な臨床応用がある。
しかし、CTスキャンから手動で臓器に注釈をつけるのは時間と労力がかかる。
半教師付き学習は、大量のラベル付き画像と限定ラベル付きサンプルから学習することで、この課題を軽減する可能性を示している。
本研究では,教師モデルと学生モデルの両方において,自己学習戦略に従い,CNNとTransformerとのハイブリッドアーキテクチャ(PHTrans)を用いて,正確な擬似ラベルを生成する。
その後、高速なPHTransを用いた2段階セグメンテーションフレームワークにラベルデータと共に導入し、効率を保ちながらモデルの性能と一般化能力を向上させる。
FLARE2022の検証実験により,提案手法は高速かつ低リソースなモデル推論だけでなく,セグメンテーション性能にも優れることを示した。
DSC と HSD はそれぞれ 0.8956 と 0.9316 である。
開発環境では、平均推定時間は18.62秒、最大GPUメモリは1995.04MB、GPUメモリタイム曲線以下の領域とCPU利用時間曲線の平均面積は23196.84および319.67である。
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