論文の概要: Domain Generalization for Prostate Segmentation in Transrectal
Ultrasound Images: A Multi-center Study
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.02126v1
- Date: Mon, 5 Sep 2022 20:20:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-07 15:01:23.292526
- Title: Domain Generalization for Prostate Segmentation in Transrectal
Ultrasound Images: A Multi-center Study
- Title(参考訳): 経直腸超音波画像における前立腺分割のための領域一般化 : 多施設共同研究
- Authors: Sulaiman Vesal, Iani Gayo, Indrani Bhattacharya, Shyam Natarajan,
Leonard S. Marks, Dean C Barratt, Richard E. Fan, Yipeng Hu, Geoffrey A.
Sonn, and Mirabela Rusu
- Abstract要約: 超音波画像における前立腺分割のための新しい2.5次元ディープニューラルネットワークを提案する。
対象は,1施設764項目で,その後10項目のみを用いてモデルを微調整した。
本手法は, 独立した被験者群で平均9.0pm0.03$, Hausdorff Distance (HD95) 平均2.28$mm$のDice類似係数(Dice)を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.571022281023314
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Prostate biopsy and image-guided treatment procedures are often performed
under the guidance of ultrasound fused with magnetic resonance images (MRI).
Accurate image fusion relies on accurate segmentation of the prostate on
ultrasound images. Yet, the reduced signal-to-noise ratio and artifacts (e.g.,
speckle and shadowing) in ultrasound images limit the performance of automated
prostate segmentation techniques and generalizing these methods to new image
domains is inherently difficult. In this study, we address these challenges by
introducing a novel 2.5D deep neural network for prostate segmentation on
ultrasound images. Our approach addresses the limitations of transfer learning
and finetuning methods (i.e., drop in performance on the original training data
when the model weights are updated) by combining a supervised domain adaptation
technique and a knowledge distillation loss. The knowledge distillation loss
allows the preservation of previously learned knowledge and reduces the
performance drop after model finetuning on new datasets. Furthermore, our
approach relies on an attention module that considers model feature positioning
information to improve the segmentation accuracy. We trained our model on 764
subjects from one institution and finetuned our model using only ten subjects
from subsequent institutions. We analyzed the performance of our method on
three large datasets encompassing 2067 subjects from three different
institutions. Our method achieved an average Dice Similarity Coefficient (Dice)
of $94.0\pm0.03$ and Hausdorff Distance (HD95) of 2.28 $mm$ in an independent
set of subjects from the first institution. Moreover, our model generalized
well in the studies from the other two institutions (Dice: $91.0\pm0.03$; HD95:
3.7$mm$ and Dice: $82.0\pm0.03$; HD95: 7.1 $mm$).
- Abstract(参考訳): 前立腺生検や画像ガイド下治療は、MRI(MRI)と融合した超音波で行うことが多い。
正確な画像融合は、超音波画像による前立腺の正確なセグメンテーションに依存する。
しかし,超音波画像における信号対雑音比とアーチファクト(スペックルやシャドーイングなど)の低減は,自動前立腺セグメンテーション技術の性能を制限し,これらの手法を新たな画像領域に一般化することは本質的に困難である。
本研究では,超音波画像の前立腺セグメンテーションのための2.5次元深層ニューラルネットワークを導入することで,これらの課題に対処した。
提案手法は,教師付きドメイン適応手法と知識蒸留損失を組み合わせることで,伝達学習と微調整手法(モデルの重みが更新されたとき,元のトレーニングデータに性能を落としてしまう)の限界に対処する。
知識蒸留損失は、学習した知識の保存を可能にし、新しいデータセットのモデル微調整後の性能低下を低減する。
さらに,セグメンテーション精度を向上させるために,モデル特徴位置情報を考慮したアテンションモジュールを用いる。
1つの機関から764名の被験者を訓練し,その後10名の被験者のみを用いてモデルを微調整した。
我々は,3つの異なる機関から2067名の被験者を対象とする3つの大規模データセット上での手法の性能を解析した。
本手法は,第1機関から独立した被験者群で平均9,4.0\pm0.03$,Hausdorff Distance(HD95)2.28$mm$のDice類似係数(Dice)を達成した。
さらに,このモデルは他の2つの機関の研究でよく一般化された (dice: 91.0\pm0.03$; hd95: 3.7$mm$; dice: 82.0\pm0.03$; hd95: 7.1$mm$)。
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