論文の概要: Assessing Coarse-to-Fine Deep Learning Models for Optic Disc and Cup
Segmentation in Fundus Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2209.14383v1
- Date: Wed, 28 Sep 2022 19:19:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-09-30 17:10:47.138728
- Title: Assessing Coarse-to-Fine Deep Learning Models for Optic Disc and Cup
Segmentation in Fundus Images
- Title(参考訳): ファウンダス画像における光学ディスクとカップセグメンテーションのための粗大な深層学習モデルの評価
- Authors: Eugenia Moris and Nicol\'as Dazeo and Maria Paula Albina de Rueda and
Francisco Filizzola and Nicol\'as Iannuzzo and Danila Nejamkin and Kevin
Wignall and Mercedes Legu\'ia and Ignacio Larrabide and Jos\'e Ignacio
Orlando
- Abstract要約: 粗い深層学習アルゴリズムは、底面画像の鉛直カップ・トゥ・ディスク比(vCDR)を効率的に測定するために用いられる。
5つの公開データベースを用いたOD/OCセグメンテーションのための粗粒度設計の包括的解析を行う。
分析の結果,これらのアルゴリズムは必ずしも標準のマルチクラスシングルステージモデルより優れているとは限らないことがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Automated optic disc (OD) and optic cup (OC) segmentation in fundus images is
relevant to efficiently measure the vertical cup-to-disc ratio (vCDR), a
biomarker commonly used in ophthalmology to determine the degree of
glaucomatous optic neuropathy. In general this is solved using coarse-to-fine
deep learning algorithms in which a first stage approximates the OD and a
second one uses a crop of this area to predict OD/OC masks. While this approach
is widely applied in the literature, there are no studies analyzing its real
contribution to the results. In this paper we present a comprehensive analysis
of different coarse-to-fine designs for OD/OC segmentation using 5 public
databases, both from a standard segmentation perspective and for estimating the
vCDR for glaucoma assessment. Our analysis shows that these algorithms not
necessarily outperfom standard multi-class single-stage models, especially when
these are learned from sufficiently large and diverse training sets.
Furthermore, we noticed that the coarse stage achieves better OD segmentation
results than the fine one, and that providing OD supervision to the second
stage is essential to ensure accurate OC masks. Moreover, both the single-stage
and two-stage models trained on a multi-dataset setting showed results in pair
or even better than other state-of-the-art alternatives, while ranking first in
REFUGE for OD/OC segmentation. Finally, we evaluated the models for vCDR
prediction in comparison with six ophthalmologists on a subset of AIROGS
images, to understand them in the context of inter-observer variability. We
noticed that vCDR estimates recovered both from single-stage and coarse-to-fine
models can obtain good glaucoma detection results even when they are not highly
correlated with manual measurements from experts.
- Abstract(参考訳): 眼科領域でよく用いられるバイオマーカーである垂直カップ・ツー・ディスク比(vCDR)を,眼科領域で効率よく測定し,緑内障性視神経障害の度合いを判定するために有用である。
一般に、第1段階がodに近似し、第2段階がこの領域の作物を用いてod/ocマスクを予測した粗いディープラーニングアルゴリズムを用いて解く。
このアプローチは文献に広く適用されているが、結果に対する実際の貢献を分析する研究はない。
本稿では,標準的なセグメンテーションの観点と緑内障評価のためのvCDR推定のための5つの公開データベースを用いて,OD/OCセグメンテーションのための粗大な設計を包括的に分析する。
分析の結果,多種多様なトレーニングセットから学習された場合,これらのアルゴリズムは必ずしも標準の多クラス単段モデルを上回るものではないことがわかった。
さらに, 粗い段では細い段よりもODセグメンテーションが良好であること, そして第2段にODを監督することが, 正確なOCマスクの確保に不可欠であることに気付いた。
さらに、マルチデータセット設定でトレーニングされたシングルステージモデルと2ステージモデルの両方が、他の最先端の代替モデルよりもペアかそれ以上良い結果を示した。
最後に,AIROGS画像のサブセットにおける6人の眼科医との比較により,vCDR予測モデルの評価を行い,サーバ間変動の文脈で理解した。
単段モデルと粗視モデルの両方から得られたvcdr推定値が,専門家の手作業による測定値と高い相関がなくても良好な緑内障検出結果が得られることがわかった。
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