論文の概要: Dual Attention Model with Reinforcement Learning for Classification of Histology Whole-Slide Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.09682v2
- Date: Thu, 21 Nov 2024 16:29:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-22 15:15:54.513163
- Title: Dual Attention Model with Reinforcement Learning for Classification of Histology Whole-Slide Images
- Title(参考訳): ストライディング画像の分類のための強化学習による二重注意モデル
- Authors: Manahil Raza, Ruqayya Awan, Raja Muhammad Saad Bashir, Talha Qaiser, Nasir M. Rajpoot,
- Abstract要約: デジタル全スライド画像(WSI)は一般に顕微鏡分解能で撮影され、広い空間データを包含する。
本稿では,病理医の視覚検査に触発された2つの主成分からなる新しい二重注意アプローチを提案する。
提案手法は,WSIの10%未満を高い倍率で処理しながら,最先端の手法に匹敵する性能を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.404881822414898
- License:
- Abstract: Digital whole slide images (WSIs) are generally captured at microscopic resolution and encompass extensive spatial data. Directly feeding these images to deep learning models is computationally intractable due to memory constraints, while downsampling the WSIs risks incurring information loss. Alternatively, splitting the WSIs into smaller patches may result in a loss of important contextual information. In this paper, we propose a novel dual attention approach, consisting of two main components, both inspired by the visual examination process of a pathologist: The first soft attention model processes a low magnification view of the WSI to identify relevant regions of interest, followed by a custom sampling method to extract diverse and spatially distinct image tiles from the selected ROIs. The second component, the hard attention classification model further extracts a sequence of multi-resolution glimpses from each tile for classification. Since hard attention is non-differentiable, we train this component using reinforcement learning to predict the location of the glimpses. This approach allows the model to focus on essential regions instead of processing the entire tile, thereby aligning with a pathologist's way of diagnosis. The two components are trained in an end-to-end fashion using a joint loss function to demonstrate the efficacy of the model. The proposed model was evaluated on two WSI-level classification problems: Human epidermal growth factor receptor 2 scoring on breast cancer histology images and prediction of Intact/Loss status of two Mismatch Repair biomarkers from colorectal cancer histology images. We show that the proposed model achieves performance better than or comparable to the state-of-the-art methods while processing less than 10% of the WSI at the highest magnification and reducing the time required to infer the WSI-level label by more than 75%.
- Abstract(参考訳): デジタル全スライド画像(WSI)は一般に顕微鏡分解能で撮影され、広い空間データを包含する。
深層学習モデルにこれらの画像を直接供給することは、情報損失のリスクを低く抑えながら、メモリ制約のために計算的に引き起こすことができる。
あるいは、WSIを小さなパッチに分割すると、重要なコンテキスト情報が失われる可能性がある。
本稿では,病理医の視覚的診察プロセスにインスパイアされた2つの主成分からなる新しい二重注意アプローチを提案する。第1のソフトアテンションモデルでは,WSIの低倍率ビューを処理して関心領域を識別し,次いで選択されたROIから多様で空間的に異なる画像タイルを抽出するカスタムサンプリング手法を提案する。
第2のコンポーネントであるハードアテンション分類モデルは、分類のために各タイルから多重解像度のスリープ列を抽出する。
注意は区別できないため、強化学習を用いてこの成分を訓練し、視線の位置を予測する。
このアプローチにより、モデルはタイル全体を処理するのではなく、必須領域に集中することができ、それによって病理学者の診断方法と整合する。
2つのコンポーネントは、モデルの有効性を示すために、ジョイントロス関数を用いてエンドツーエンドで訓練される。
乳がん組織像から評価したヒト上皮成長因子受容体2と,大腸癌組織像から得られた2つのMismatch修復バイオマーカーのIntact/Loss状態の予測を行った。
提案手法は,WSIの10%未満を最大倍率で処理し,WSIレベルのラベルを75%以上推論するのに要する時間を削減しながら,最先端の手法に匹敵する性能を実現する。
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