論文の概要: EmbryosFormer: Deformable Transformer and Collaborative Encoding-Decoding for Embryos Stage Development Classification

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2210.04615v1
• Date: Fri, 7 Oct 2022 02:54:34 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-10-11 18:05:06.005944
• Title: EmbryosFormer: Deformable Transformer and Collaborative Encoding-Decoding for Embryos Stage Development Classification
• Title（参考訳）: EmbryosFormer:Embryosステージ開発分類のための変形可能な変換器と協調エンコーディング
• Authors: Tien-Phat Nguyen, Trong-Thang Pham, Tri Nguyen, Hieu Le, Dung Nguyen, Hau Lam, Phong Nguyen, Jennifer Fowler, Minh-Triet Tran, Ngan Le
• Abstract要約: タイムラプス画像から細胞分裂を自動的に検出・分類する計算モデルであるEmbryosFormerを提案する。 提案するネットワークは,コラボレーティブヘッドを用いたエンコーダデコーダデフォーマブルトランスとして設計されている。 提案したEmbryosFormerを,8細胞ステージのマウス胚を用いた公開データセットと4細胞ステージのヒト胚を用いた社内データセットの2つのデータセットでベンチマークした。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 11.773779045556653
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: The timing of cell divisions in early embryos during the In-Vitro Fertilization (IVF) process is a key predictor of embryo viability. However, observing cell divisions in Time-Lapse Monitoring (TLM) is a time-consuming process and highly depends on experts. In this paper, we propose EmbryosFormer, a computational model to automatically detect and classify cell divisions from original time-lapse images. Our proposed network is designed as an encoder-decoder deformable transformer with collaborative heads. The transformer contracting path predicts per-image labels and is optimized by a classification head. The transformer expanding path models the temporal coherency between embryo images to ensure monotonic non-decreasing constraint and is optimized by a segmentation head. Both contracting and expanding paths are synergetically learned by a collaboration head. We have benchmarked our proposed EmbryosFormer on two datasets: a public dataset with mouse embryos with 8-cell stage and an in-house dataset with human embryos with 4-cell stage. Source code: https://github.com/UARK-AICV/Embryos.
• Abstract（参考訳）: In-Vitro Fertilization (IVF) 過程における初期胚の細胞分裂のタイミングは、胚の生存可能性の重要な予測因子である。 しかし、TLM(Time-Lapse Monitoring)における細胞分裂の観察は時間を要するプロセスであり、専門家に大きく依存する。 本稿では,従来のタイムラプス画像から細胞分裂を自動的に検出・分類する計算モデルであるEmbryosFormerを提案する。 提案するネットワークは,コラボレーティブヘッドを用いたエンコーダデコーダデフォーマブルトランスとして設計されている。 トランス収縮経路は画像毎のラベルを予測し、分類ヘッドにより最適化される。 トランス膨張経路は、胚画像間の時間的コヒーレンスをモデル化し、単調な非減少制約を確実にし、セグメンテーションヘッドにより最適化される。 収縮と拡張の両方のパスは、コラボレーションヘッドによって相乗的に学習される。 提案したEmbryosFormerを,8細胞ステージのマウス胚を用いた公開データセットと4細胞ステージのヒト胚を用いた社内データセットの2つのデータセットでベンチマークした。 ソースコード:https://github.com/UARK-AICV/Embryos。

関連論文リスト

• Rethinking Attention Gated with Hybrid Dual Pyramid Transformer-CNN for Generalized Segmentation in Medical Imaging [17.07490339960335]
  本稿では,強力なCNN-Transformerエンコーダを効率的に構築するためのハイブリッドCNN-Transformerセグメンテーションアーキテクチャ(PAG-TransYnet)を提案する。 我々のアプローチは、デュアルピラミッドハイブリッドエンコーダ内のアテンションゲートを利用する。
  論文  参考訳（メタデータ） (2024-04-28T14:37:10Z)
• Affine-Consistent Transformer for Multi-Class Cell Nuclei Detection [76.11864242047074]
  本稿では, 原子核位置を直接生成する新しいアフィン一貫性変換器 (AC-Former) を提案する。 本稿では,AAT (Adaptive Affine Transformer) モジュールを導入し,ローカルネットワークトレーニングのためのオリジナル画像をワープするための重要な空間変換を自動学習する。 実験結果から,提案手法は様々なベンチマークにおいて既存の最先端アルゴリズムを著しく上回ることがわかった。
  論文  参考訳（メタデータ） (2023-10-22T02:27:02Z)
• CATS v2: Hybrid encoders for robust medical segmentation [12.194439938007672]
  畳み込みニューラルネットワーク(CNN)は、医用画像分割タスクにおいて強力な性能を示した。 しかし、畳み込みカーネルの視野が限られているため、CNNがグローバル情報を完全に表現することは困難である。 ローカル情報とグローバル情報の両方を活用するハイブリッドエンコーダを用いたCATS v2を提案する。
  論文  参考訳（メタデータ） (2023-08-11T20:21:54Z)
• HiFormer: Hierarchical Multi-scale Representations Using Transformers for Medical Image Segmentation [3.478921293603811]
  HiFormerは、医用画像セグメンテーションのためのCNNとトランスフォーマーを効率的にブリッジする新しい方法である。 グローバルな特徴とローカルな特徴の微細融合を確保するため,エンコーダ・デコーダ構造のスキップ接続におけるDouble-Level Fusion (DLF)モジュールを提案する。
  論文  参考訳（メタデータ） (2022-07-18T11:30:06Z)
• MISSU: 3D Medical Image Segmentation via Self-distilling TransUNet [55.16833099336073]
  医用画像セグメンテーションのためのトランスフォーマーベースUNetを提案する。 グローバルな意味情報と局所的な空間的詳細特徴を同時に学習する。 MISSUは従来の最先端手法よりも優れた性能を発揮する。
  論文  参考訳（メタデータ） (2022-06-02T07:38:53Z)
• SepTr: Separable Transformer for Audio Spectrogram Processing [74.41172054754928]
  分離可能トランス (Separable Transformer, SepTr) と呼ばれる新しい視覚変換器アーキテクチャを提案する。 SepTrは2つのトランスフォーマーブロックを逐次的に使用し、1つは同じ周波数ビン内のトークンに、もう1つは同じ時間間隔でトークンに出席する。 我々は3つのベンチマークデータセットで実験を行い、我々のアーキテクチャが従来のビジョントランスフォーマーや他の最先端の手法よりも優れていることを示す。
  論文  参考訳（メタデータ） (2022-03-17T19:48:43Z)
• nnFormer: Interleaved Transformer for Volumetric Segmentation [50.10441845967601]
  本稿では,自己意図と畳み込みを実証的に組み合わせた,インターリーブアーキテクチャを備えた強力なセグメンテーションモデルであるnnFormerを紹介する。 nnFormerは、SynapseとACDCの2つの一般的なデータセットで、以前のTransformerベースのメソッドよりも大幅に改善されている。
  論文  参考訳（メタデータ） (2021-09-07T17:08:24Z)
• Developmental Stage Classification of EmbryosUsing Two-Stream Neural Network with Linear-Chain Conditional Random Field [74.53314729742966]
  発達段階分類のための2ストリームモデルを提案する。 従来の手法とは異なり、2ストリームモデルでは時間情報と画像情報の両方を受け付けている。 2つのタイムラプス胚ビデオデータセット上で,本アルゴリズムを実証する。
  論文  参考訳（メタデータ） (2021-07-13T19:56:01Z)
• Swin-Unet: Unet-like Pure Transformer for Medical Image Segmentation [63.46694853953092]
  Swin-Unetは、医用画像セグメンテーション用のUnetライクなトランスフォーマーである。 トークン化されたイメージパッチは、TransformerベースのU字型デコーダデコーダアーキテクチャに供給される。
  論文  参考訳（メタデータ） (2021-05-12T09:30:26Z)

関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。

指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト（すべての情報・翻訳含む）の品質を保証せず、本サイト（すべての情報・翻訳含む）を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。