論文の概要: Automated MRI Field of View Prescription from Region of Interest
Prediction by Intra-stack Attention Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.04703v1
- Date: Wed, 9 Nov 2022 06:40:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-10 17:43:07.412483
- Title: Automated MRI Field of View Prescription from Region of Interest
Prediction by Intra-stack Attention Neural Network
- Title(参考訳): スタック内アテンションニューラルネットワークによる関心予測領域からのビュー記述の自動MRIフィールド
- Authors: Ke Lei, Ali B. Syed, Xucheng Zhu, John M. Pauly, Shreyas S. Vasanawala
- Abstract要約: MRI技術者による視野のマニュアル処方(FOV)は可変であり、スキャンプロセスを延長する。
本稿では,放射線科医の指導のもと,FOV処方薬の自動化のためのディープラーニングフレームワークを提案する。
提案モデルでは,平均IoUは0.867で,平均ROI位置誤差は80のケースで512ピクセル中9.06である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.247651979368062
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Manual prescription of the field of view (FOV) by MRI technologists is
variable and prolongs the scanning process. Often, the FOV is too large or
crops critical anatomy. We propose a deep-learning framework, trained by
radiologists' supervision, for automating FOV prescription. An intra-stack
shared feature extraction network and an attention network are used to process
a stack of 2D image inputs to generate output scalars defining the location of
a rectangular region of interest (ROI). The attention mechanism is used to make
the model focus on the small number of informative slices in a stack. Then the
smallest FOV that makes the neural network predicted ROI free of aliasing is
calculated by an algebraic operation derived from MR sampling theory. We
retrospectively collected 595 cases between February 2018 and February 2022.
The framework's performance is examined quantitatively with intersection over
union (IoU) and pixel error on position, and qualitatively with a reader study.
We use the t-test for comparing quantitative results from all models and a
radiologist. The proposed model achieves an average IoU of 0.867 and average
ROI position error of 9.06 out of 512 pixels on 80 test cases, significantly
better (P<0.05) than two baseline models and not significantly different from a
radiologist (P>0.12). Finally, the FOV given by the proposed framework achieves
an acceptance rate of 92% from an experienced radiologist.
- Abstract(参考訳): mri技術者によるフィールドオブビュー(fov)の手動処方は可変であり、走査プロセスを延長する。
FOVは大きすぎるか、作物にとって重要な解剖学であることが多い。
本稿では,放射線科医が指導する深層学習フレームワークを提案する。
スタック内共有特徴抽出ネットワークと注意ネットワークを用いて、2d画像入力のスタックを処理し、関心の矩形領域(roi)の位置を定義する出力スカラーを生成する。
注意機構は、モデルがスタック内の少数の情報的なスライスに焦点を合わせるために使用される。
次に、MRサンプリング理論から導かれる代数演算により、ニューラルネットワークの予測ROIをエイリアシングから解放する最小のFOVを算出する。
2018年2月から2022年2月までに595例を回顧調査した。
フレームワークの性能は、結合(IoU)と位置の画素誤差とを定量的に比較し、また、読者による研究と定性的に比較する。
我々は,全モデルと放射線科医の定量的結果を比較するためにt-testを用いた。
提案モデルでは, 平均IoU 0.867, 平均ROI 誤差は512ピクセル中9.06, 2基モデルではP<0.05) が有意に向上し, 放射線学ではP>0.12) と有意差は認められなかった。
最後に, 提案したフレームワークによるFOVは, 経験者から92%の受入率を達成する。
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