論文の概要: Bayesian Optimization of 2D Echocardiography Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2211.09888v1
- Date: Thu, 17 Nov 2022 20:52:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-21 15:53:29.616666
- Title: Bayesian Optimization of 2D Echocardiography Segmentation
- Title(参考訳): 2次元心エコーセグメンテーションのベイズ最適化
- Authors: Son-Tung Tran, Joshua V. Stough, Xiaoyan Zhang, Christopher M.
Haggerty
- Abstract要約: BOを用いて、深層畳み込みニューラルネットワークモデルのアーキテクチャおよびトレーニング関連ハイパーパラメータを最適化する。
左室心内膜(LV)、左心内膜(LV)、左心房に0.95、0.96、0.93の重なりがある。
また,LV終末容積の中央値絶対誤差を小さくするなど,導出性臨床指標の大幅な改善も観察した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6947715121689204
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Bayesian Optimization (BO) is a well-studied hyperparameter tuning technique
that is more efficient than grid search for high-cost, high-parameter machine
learning problems. Echocardiography is a ubiquitous modality for evaluating
heart structure and function in cardiology. In this work, we use BO to optimize
the architectural and training-related hyperparameters of a previously
published deep fully convolutional neural network model for multi-structure
segmentation in echocardiography. In a fair comparison, the resulting model
outperforms this recent state-of-the-art on the annotated CAMUS dataset in both
apical two- and four-chamber echo views. We report mean Dice overlaps of 0.95,
0.96, and 0.93 on left ventricular (LV) endocardium, LV epicardium, and left
atrium respectively. We also observe significant improvement in derived
clinical indices, including smaller median absolute errors for LV end-diastolic
volume (4.9mL vs. 6.7), end-systolic volume (3.1mL vs. 5.2), and ejection
fraction (2.6% vs. 3.7); and much tighter limits of agreement, which were
already within inter-rater variability for non-contrast echo. These results
demonstrate the benefits of BO for echocardiography segmentation over a recent
state-of-the-art framework, although validation using large-scale independent
clinical data is required.
- Abstract(参考訳): Bayesian Optimization (BO)は、高コストで高パラメータな機械学習問題のグリッド探索よりも効率的である、よく研究されたハイパーパラメータチューニング技術である。
心エコー図は心電図の心臓構造と機能を評価するためのユビキタスモードである。
本研究では,心エコー図における多構造セグメンテーションのための深層畳み込みニューラルネットワークモデルのアーキテクチャおよびトレーニング関連ハイパーパラメータをBOを用いて最適化する。
比較すると、結果として得られたモデルは、apical two-および4-chamber echoビューの両方で、アノテーション付きcamusデータセットの最近の最先端を上回っている。
左心室(LV)心内膜,左心室,左心房のDiceオーバーラップは0.95,0.96,0.93であった。
また, lvエンドダイアストリックボリューム (4.9ml vs. 6.7), エンドシストリックボリューム (3.1ml vs. 5.2) および射出率 (2.6% vs. 3.7) に対する中央値の絶対誤差を小さくし, 既に非コントラストエコーのレート間変動範囲内にある一致限界をかなり厳しくした。
これらの結果から,心臓エコー検査におけるboの有用性が示されるが,大規模独立臨床データを用いた検証が必要である。
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