論文の概要: Evaluation of state-of-the-art deep learning models in the segmentation of the heart ventricles in parasternal short-axis echocardiograms
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.08970v1
- Date: Wed, 12 Mar 2025 00:33:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-13 15:36:57.277496
- Title: Evaluation of state-of-the-art deep learning models in the segmentation of the heart ventricles in parasternal short-axis echocardiograms
- Title(参考訳): 特発性短軸心エコー図における心室分画における最先端ディープラーニングモデルの評価
- Authors: Julian Rene Cuellar Buritica, Vu Dinh, Manjula Burri, Julie Roelandts, James Wendling, Jon D. Klingensmith,
- Abstract要約: 胸部短軸心エコー図(PSAX-echo)における心室のセグメンテーションによる深層学習モデルの評価
深層学習モデルはPSAX-echoの左室と右室のセグメンテーションに適したモデルである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: Previous studies on echocardiogram segmentation are focused on the left ventricle in parasternal long-axis views. In this study, deep-learning models were evaluated on the segmentation of the ventricles in parasternal short-axis echocardiograms (PSAX-echo). Segmentation of the ventricles in complementary echocardiogram views will allow the computation of important metrics with the potential to aid in diagnosing cardio-pulmonary diseases and other cardiomyopathies. Evaluating state-of-the-art models with small datasets can reveal if they improve performance on limited data. PSAX-echo were performed on 33 volunteer women. An experienced cardiologist identified end-diastole and end-systole frames from 387 scans, and expert observers manually traced the contours of the cardiac structures. Traced frames were pre-processed and used to create labels to train 2 specific-domain (Unet-Resnet101 and Unet-ResNet50), and 4 general-domain (3 Segment Anything (SAM) variants, and the Detectron2) deep-learning models. The performance of the models was evaluated using the Dice similarity coefficient (DSC), Hausdorff distance (HD), and difference in cross-sectional area (DCSA). The Unet-Resnet101 model provided superior performance in the segmentation of the ventricles with 0.83, 4.93 pixels, and 106 pixel2 on average for DSC, HD, and DCSA respectively. A fine-tuned MedSAM model provided a performance of 0.82, 6.66 pixels, and 1252 pixel2, while the Detectron2 model provided 0.78, 2.12 pixels, and 116 pixel2 for the same metrics respectively. Deep-learning models are suitable for the segmentation of the left and right ventricles in PSAX-echo. This study demonstrated that specific-domain trained models such as Unet-ResNet provide higher accuracy for echo segmentation than general-domain segmentation models when working with small and locally acquired datasets.
- Abstract(参考訳): 左心室における心エコー図のセグメンテーションに関する先行研究について検討した。
本研究では, 心室細心エコー法(PSAX-echo)を用いて, 心室細心のセグメンテーションによる深層学習モデルの評価を行った。
心エコー図における心室の分画は、心肺疾患やその他の心筋症を診断するのに役立つ可能性がある重要な指標の計算を可能にする。
小さなデータセットで最先端モデルを評価することで、限られたデータのパフォーマンスを改善することができる。
33名のボランティア女性に対してPSAX-echoを施行した。
経験豊富な心臓科医が387個のスキャンからエンドジゾールとエンドシストールのフレームを特定し、専門家が手動で心臓構造の輪郭を追跡した。
トレースされたフレームは前処理され、2つの特定のドメイン(Unet-Resnet101とUnet-ResNet50)と4つの汎用ドメイン(SAM)のモデル、そしてディテクトロン2のディープラーニングモデルをトレーニングするためのラベルを作成するために使用された。
モデルの性能はDice similarity coefficient (DSC), Hausdorff distance (HD), and difference in cross-sectional area (DCSA)を用いて評価した。
Unet-Resnet101モデルは、それぞれDSC、HD、DCSAで平均0.83ピクセル、4.93ピクセル、106ピクセルの心室のセグメンテーションにおいて優れた性能を示した。
微調整のMedSAMモデルでは0.82ピクセル、6.66ピクセル、1252ピクセル、ディテクトロン2モデルは0.78ピクセル、2.12ピクセル、116ピクセルがそれぞれ同じ測定値である。
深層学習モデルはPSAX-echoの左室と右室のセグメンテーションに適したモデルである。
本研究では、Unet-ResNetのような特定のドメインの訓練されたモデルが、小さくて局所的に取得したデータセットを扱う場合、一般ドメインのセグメンテーションモデルよりも高い精度でエコーセグメンテーションを行うことを示した。
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