論文の概要: Energy-based Generative Models for Target-specific Drug Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.02404v1
- Date: Mon, 5 Dec 2022 16:41:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-06 18:07:46.140963
- Title: Energy-based Generative Models for Target-specific Drug Discovery
- Title(参考訳): ターゲット特異的薬物発見のためのエネルギーベース生成モデル
- Authors: Junde Li, Collin Beaudoin, Swaroop Ghosh
- Abstract要約: 我々は, 目標特異的な薬物発見のためのエネルギーベース確率モデルを開発した。
その結果,提案したTagMolは実分子と類似の結合親和性を持つ分子を生成できることが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.509129971169722
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Drug targets are the main focus of drug discovery due to their key role in
disease pathogenesis. Computational approaches are widely applied to drug
development because of the increasing availability of biological molecular
datasets. Popular generative approaches can create new drug molecules by
learning the given molecule distributions. However, these approaches are mostly
not for target-specific drug discovery. We developed an energy-based
probabilistic model for computational target-specific drug discovery. Results
show that our proposed TagMol can generate molecules with similar binding
affinity scores as real molecules. GAT-based models showed faster and better
learning relative to GCN baseline models.
- Abstract(参考訳): 薬物ターゲットは、疾患の病因形成において重要な役割を担っているため、薬物発見の主要な焦点である。
計算手法は、生物分子データセットの可用性が高まるため、薬物開発に広く応用されている。
一般的な生成アプローチは、与えられた分子分布を学習することで新しい薬物分子を作ることができる。
しかし、これらのアプローチは標的特異的な薬物発見のためのものではない。
計算対象特異的な薬物発見のためのエネルギーベースの確率モデルを開発した。
その結果,提案するtagmolは実際の分子と同様の結合親和性スコアを持つ分子を生成できることがわかった。
GATベースのモデルでは、GCNベースラインモデルと比較して、より高速で学習性が向上した。
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