論文の概要: P2T2: a Physically-primed deep-neural-network approach for robust
$T_{2}$ distribution estimation from quantitative $T_{2}$-weighted MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.04928v2
- Date: Wed, 17 May 2023 20:07:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-19 20:33:27.260511
- Title: P2T2: a Physically-primed deep-neural-network approach for robust
$T_{2}$ distribution estimation from quantitative $T_{2}$-weighted MRI
- Title(参考訳): p2t2:量的$t_{2}$重み付けmriによるロバストな$t_{2}$分布推定のための物理的素数深層神経ネットワークアプローチ
- Authors: Hadas Ben-Atya and Moti Freiman
- Abstract要約: MRIデータからT$の緩和時間分布を推定すると、様々な病態における炎症、脱髄、浮腫、軟骨組成を評価する貴重なバイオマーカーが得られる。
ディープニューラルネットワーク(DNN)に基づく手法は、MRIデータから$T$分布を推定する逆問題に対処するために提案されているが、SNR(Signal-to-Noise ratio)の低い臨床データには十分ではない。
我々は、信号減衰を前方に組み込む、$PT$と呼ばれる物理的に高価なDNNアプローチを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Estimating $T_2$ relaxation time distributions from multi-echo $T_2$-weighted
MRI ($T_2W$) data can provide valuable biomarkers for assessing inflammation,
demyelination, edema, and cartilage composition in various pathologies,
including neurodegenerative disorders, osteoarthritis, and tumors. Deep neural
network (DNN) based methods have been proposed to address the complex inverse
problem of estimating $T_2$ distributions from MRI data, but they are not yet
robust enough for clinical data with low Signal-to-Noise ratio (SNR) and are
highly sensitive to distribution shifts such as variations in echo-times (TE)
used during acquisition. Consequently, their application is hindered in
clinical practice and large-scale multi-institutional trials with heterogeneous
acquisition protocols. We propose a physically-primed DNN approach, called
$P_2T_2$, that incorporates the signal decay forward model in addition to the
MRI signal into the DNN architecture to improve the accuracy and robustness of
$T_2$ distribution estimation. We evaluated our $P_2T_2$ model in comparison to
both DNN-based methods and classical methods for $T_2$ distribution estimation
using 1D and 2D numerical simulations along with clinical data. Our model
improved the baseline model's accuracy for low SNR levels ($SNR<80$) which are
common in the clinical setting. Further, our model achieved a $\sim$35\%
improvement in robustness against distribution shifts in the acquisition
process compared to previously proposed DNN models. Finally, Our $P_2T_2$ model
produces the most detailed Myelin-Water fraction maps compared to baseline
approaches when applied to real human MRI data. Our $P_2T_2$ model offers a
reliable and precise means of estimating $T_2$ distributions from MRI data and
shows promise for use in large-scale multi-institutional trials with
heterogeneous acquisition protocols.
- Abstract(参考訳): マルチエチョ$T_2$-weighted MRI(T_2W$)データからの緩和時間分布を推定すると、神経変性疾患、変形性関節症、腫瘍を含む様々な病態における炎症、脱髄、浮腫、軟骨組成を評価する貴重なバイオマーカーが提供される。
ディープニューラルネットワーク(DNN)に基づく手法は、MRIデータから$T_2$分布を推定する複雑な逆問題に対処するために提案されているが、SNR(Signal-to-Noise ratio)の低い臨床データに対してはまだ十分に堅牢ではなく、取得時に使用するエコー時間(TE)の変動のような分布シフトに非常に敏感である。
その結果, 臨床実践や大規模多施設試験において, 不均質な獲得プロトコルを用いた適用が阻害される。
我々は,DNNアーキテクチャにMRI信号に加えて信号減衰前処理モデルを組み込んで,$T_2$分布推定の精度とロバスト性を向上する,$P_2T_2$という物理価格のDNN手法を提案する。
1次元および2次元の数値シミュレーションと臨床データを用いて,dnn法および古典法との比較により,$p_2t_2$モデルを評価した。
本モデルでは,臨床でよく見られる低snr値(snr<80$)の基準モデルの精度を改善した。
さらに, 提案したDNNモデルと比較して, 獲得過程における分布変化に対するロバスト性は$\sim$35\%向上した。
最後に、我々の$P_2T_2$モデルは、実際のMRIデータに適用した場合のベースラインアプローチと比較して、最も詳細なMyelin-Water分画マップを生成する。
我々の$P_2T_2$モデルはMRIデータからT_2$分布を推定する信頼性と正確な手段を提供し、異種取得プロトコルを用いた大規模多施設試験での使用を約束する。
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