論文の概要: NEEDED: Introducing Hierarchical Transformer to Eye Diseases Diagnosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.13408v1
- Date: Tue, 27 Dec 2022 08:37:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-29 15:35:42.967771
- Title: NEEDED: Introducing Hierarchical Transformer to Eye Diseases Diagnosis
- Title(参考訳): NEEDED:眼疾患診断のための階層変換器の導入
- Authors: Xu Ye, Meng Xiao, Zhiyuan Ning, Weiwei Dai, Wenjuan Cui, Yi Du,
Yuanchun Zhou
- Abstract要約: 本報告では,眼科領域における眼科領域の自動診断フレームワークNEEDEDについて述べる。
情報密度と品質を改善するために前処理モジュールを統合する。
診断部では,病原性情報を取得することにより,追跡可能な診断を可能にする注意ベースの予測器を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.608716029921948
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: With the development of natural language processing techniques(NLP),
automatic diagnosis of eye diseases using ophthalmology electronic medical
records (OEMR) has become possible. It aims to evaluate the condition of both
eyes of a patient respectively, and we formulate it as a particular multi-label
classification task in this paper. Although there are a few related studies in
other diseases, automatic diagnosis of eye diseases exhibits unique
characteristics. First, descriptions of both eyes are mixed up in OEMR
documents, with both free text and templated asymptomatic descriptions,
resulting in sparsity and clutter of information. Second, OEMR documents
contain multiple parts of descriptions and have long document lengths. Third,
it is critical to provide explainability to the disease diagnosis model. To
overcome those challenges, we present an effective automatic eye disease
diagnosis framework, NEEDED. In this framework, a preprocessing module is
integrated to improve the density and quality of information. Then, we design a
hierarchical transformer structure for learning the contextualized
representations of each sentence in the OEMR document. For the diagnosis part,
we propose an attention-based predictor that enables traceable diagnosis by
obtaining disease-specific information. Experiments on the real dataset and
comparison with several baseline models show the advantage and explainability
of our framework.
- Abstract(参考訳): 自然言語処理技術(NLP)の発展に伴い,眼科電子医療記録(OEMR)を用いた眼疾患の自動診断が可能となった。
本研究の目的は,患者の両眼の状態をそれぞれ評価し,特定の多言語分類タスクとして定式化することである。
他の疾患にはいくつかの関連研究があるが、眼疾患の自動診断には独特の特徴がある。
第一に、両目の記述はOEMR文書に混在し、自由テキストとテンプレート化された無症状記述の両方が混在し、情報のばらつきと混乱をもたらす。
第2に、OEMR文書は記述の複数の部分を含み、長い文書の長さを持つ。
第3に,疾患診断モデルに説明可能性を提供することが重要である。
これらの課題を克服するために, NEEDED の有効自動眼科診断フレームワークを提案する。
このフレームワークでは、情報密度と品質を改善するために前処理モジュールを統合する。
次に,各文の文脈化表現を学習するための階層的トランスフォーマ構造をoemr文書で設計する。
診断部では,病原性情報を取得することにより,追跡可能な診断を可能にする注意ベースの予測器を提案する。
実際のデータセットといくつかのベースラインモデルとの比較実験は、我々のフレームワークの利点と説明可能性を示している。
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