論文の概要: Benchmarking common uncertainty estimation methods with
histopathological images under domain shift and label noise
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.01054v2
- Date: Thu, 6 Jul 2023 10:38:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-07 18:10:41.914830
- Title: Benchmarking common uncertainty estimation methods with
histopathological images under domain shift and label noise
- Title(参考訳): ドメインシフトとラベルノイズ下での病理像を用いた共通不確実性推定手法のベンチマーク
- Authors: Hendrik A. Mehrtens, Alexander Kurz, Tabea-Clara Bucher, Titus J.
Brinker
- Abstract要約: リスクの高い環境では、深層学習モデルは不確実性を判断し、誤分類の可能性がかなり高い場合に入力を拒否しなければなりません。
我々は,全スライド画像の分類において,最もよく使われている不確実性と頑健さの厳密な評価を行う。
我々は一般的に,手法のアンサンブルが,ドメインシフトやラベルノイズに対するロバスト性の向上とともに,より良い不確実性評価につながることを観察する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 62.997667081978825
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: In the past years, deep learning has seen an increase in usage in the domain
of histopathological applications. However, while these approaches have shown
great potential, in high-risk environments deep learning models need to be able
to judge their uncertainty and be able to reject inputs when there is a
significant chance of misclassification. In this work, we conduct a rigorous
evaluation of the most commonly used uncertainty and robustness methods for the
classification of Whole Slide Images, with a focus on the task of selective
classification, where the model should reject the classification in situations
in which it is uncertain. We conduct our experiments on tile-level under the
aspects of domain shift and label noise, as well as on slide-level. In our
experiments, we compare Deep Ensembles, Monte-Carlo Dropout, Stochastic
Variational Inference, Test-Time Data Augmentation as well as ensembles of the
latter approaches. We observe that ensembles of methods generally lead to
better uncertainty estimates as well as an increased robustness towards domain
shifts and label noise, while contrary to results from classical computer
vision benchmarks no systematic gain of the other methods can be shown. Across
methods, a rejection of the most uncertain samples reliably leads to a
significant increase in classification accuracy on both in-distribution as well
as out-of-distribution data. Furthermore, we conduct experiments comparing
these methods under varying conditions of label noise. Lastly, we publish our
code framework to facilitate further research on uncertainty estimation on
histopathological data.
- Abstract(参考訳): 近年, 病理組織学的応用分野における深層学習の利用が増加している。
しかし、これらのアプローチは大きな可能性を示しているが、リスクの高い環境では、ディープラーニングモデルは不確実性を判断し、誤分類の可能性がかなり高い場合に入力を拒否できる必要がある。
本研究は,スライド画像全体の分類において,最も一般的に用いられる不確かさとロバストネスの手法を厳密に評価し,不確かでない状況においてモデルが分類を拒絶すべき選択分類のタスクに着目した。
我々は、ドメインシフトやラベルノイズの面からタイルレベルの実験を行い、スライドレベルの実験も行います。
実験では,Deep Ensembles,Monte-Carlo Dropout,Stochastic Variational Inference,Test-Time Data Augmentation,および後者のアプローチのアンサンブルを比較した。
従来のコンピュータビジョンベンチマークの結果とは対照的に,一般に手法のアンサンブルが不確実性評価を向上し,ドメインシフトやラベルノイズに対するロバスト性も向上するが,他の手法の体系的な利得は示さない。
方法全体では、最も不確実なサンプルの拒絶は、分布内および分布外データの両方の分類精度を確実に向上させる。
さらに,これらの手法をラベルノイズの異なる条件下で比較する実験を行った。
最後に,病理組織学的データに対する不確実性推定のさらなる研究を促進するために,コードフレームワークを公開する。
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