論文の概要: NODAGS-Flow: Nonlinear Cyclic Causal Structure Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.01849v1
- Date: Wed, 4 Jan 2023 23:28:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-01-06 13:51:45.764495
- Title: NODAGS-Flow: Nonlinear Cyclic Causal Structure Learning
- Title(参考訳): NODAGS-Flow:非線形周期因果構造学習
- Authors: Muralikrishnna G. Sethuraman, Romain Lopez, Rahul Mohan, Faramarz
Fekri, Tommaso Biancalani, Jan-Christian H\"utter
- Abstract要約: 我々はNODAGS-Flowと呼ばれる介入データから非線形循環因果モデルを学習するための新しいフレームワークを提案する。
構造回復と予測性能に対する最先端手法と比較して,本手法による大幅な性能向上を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.20217860574125
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Learning causal relationships between variables is a well-studied problem in
statistics, with many important applications in science. However, modeling
real-world systems remain challenging, as most existing algorithms assume that
the underlying causal graph is acyclic. While this is a convenient framework
for developing theoretical developments about causal reasoning and inference,
the underlying modeling assumption is likely to be violated in real systems,
because feedback loops are common (e.g., in biological systems). Although a few
methods search for cyclic causal models, they usually rely on some form of
linearity, which is also limiting, or lack a clear underlying probabilistic
model. In this work, we propose a novel framework for learning nonlinear cyclic
causal graphical models from interventional data, called NODAGS-Flow. We
perform inference via direct likelihood optimization, employing techniques from
residual normalizing flows for likelihood estimation. Through synthetic
experiments and an application to single-cell high-content perturbation
screening data, we show significant performance improvements with our approach
compared to state-of-the-art methods with respect to structure recovery and
predictive performance.
- Abstract(参考訳): 変数間の因果関係の学習は統計学においてよく研究された問題であり、科学において多くの重要な応用がある。
しかし、既存のアルゴリズムの多くは、根底にある因果グラフが非循環であると仮定している。
これは因果推論と推論に関する理論的発展を開発するための便利なフレームワークであるが、フィードバックループが一般的である(生物学的システムなど)ため、基礎となるモデリング仮定は実システムでは破られる可能性が高い。
巡回因果モデルを探索する手法はいくつかあるが、通常はある種の線形性に依存しており、これは制限でもあるか、あるいは明確な確率モデルを持たない。
本研究では,NODAGS-Flowと呼ばれる介入データから非線形巡回因果グラフモデルを学習するための新しいフレームワークを提案する。
推定には残差正規化流の手法を応用し, 直接帰属最適化による推定を行う。
合成実験と単セル高濃度摂動スクリーニングデータの適用により,構造回復および予測性能に関する最先端手法と比較して,本手法による大幅な性能向上を示す。
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