論文の概要: Between Generating Noise and Generating Images: Noise in the Correct
Frequency Improves the Quality of Synthetic Histopathology Images for Digital
Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.06549v1
- Date: Mon, 13 Feb 2023 17:49:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-14 14:35:15.040779
- Title: Between Generating Noise and Generating Images: Noise in the Correct
Frequency Improves the Quality of Synthetic Histopathology Images for Digital
Pathology
- Title(参考訳): ノイズ生成と画像生成--デジタル病理診断のための合成組織病理画像の品質向上-
- Authors: Nati Daniel, Eliel Aknin, Ariel Larey, Yoni Peretz, Guy Sela, Yael
Fisher, Yonatan Savir
- Abstract要約: 合成画像は、既存のデータセットを拡張し、AIアルゴリズムを改善し、検証する。
意味マスクに適切な空間周波数でランダムな単一画素ノイズを導入することで,合成画像の品質が劇的に向上することを示す。
我々の研究は、制限のないデータセットに対する需要に基づいて合成データを生成するためのシンプルで強力なアプローチを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Artificial intelligence and machine learning techniques have the promise to
revolutionize the field of digital pathology. However, these models demand
considerable amounts of data, while the availability of unbiased training data
is limited. Synthetic images can augment existing datasets, to improve and
validate AI algorithms. Yet, controlling the exact distribution of cellular
features within them is still challenging. One of the solutions is harnessing
conditional generative adversarial networks that take a semantic mask as an
input rather than a random noise. Unlike other domains, outlining the exact
cellular structure of tissues is hard, and most of the input masks depict
regions of cell types. However, using polygon-based masks introduce inherent
artifacts within the synthetic images - due to the mismatch between the polygon
size and the single-cell size. In this work, we show that introducing random
single-pixel noise with the appropriate spatial frequency into a polygon
semantic mask can dramatically improve the quality of the synthetic images. We
used our platform to generate synthetic images of immunohistochemistry-treated
lung biopsies. We test the quality of the images using a three-fold validation
procedure. First, we show that adding the appropriate noise frequency yields
87% of the similarity metrics improvement that is obtained by adding the actual
single-cell features. Second, we show that the synthetic images pass the Turing
test. Finally, we show that adding these synthetic images to the train set
improves AI performance in terms of PD-L1 semantic segmentation performances.
Our work suggests a simple and powerful approach for generating synthetic data
on demand to unbias limited datasets to improve the algorithms' accuracy and
validate their robustness.
- Abstract(参考訳): 人工知能と機械学習技術は、デジタル病理学の分野に革命をもたらすだろう。
しかし、これらのモデルはかなりの量のデータを要求するが、偏りのないトレーニングデータの可用性は限られている。
合成画像は既存のデータセットを拡張し、AIアルゴリズムを改善し、検証することができる。
しかし、細胞の特徴の正確な分布を制御することは依然として難しい。
解決策の1つは、ランダムノイズではなく、セマンティックマスクを入力として扱う条件付き生成敵ネットワークを利用することである。
他の領域とは異なり、組織の正確な細胞構造を概説することは難しく、入力マスクの多くは細胞タイプの領域を描写している。
しかし、ポリゴンマスクを使用すると、ポリゴンサイズと単細胞サイズとのミスマッチのため、合成画像に固有のアーティファクトが導入される。
本研究では,適切な空間周波数のランダムな単一画素ノイズをポリゴン意味マスクに導入することで,合成画像の品質が劇的に向上することを示す。
免疫組織化学処理肺生検の合成画像の作成に当院のプラットフォームを用いた。
画像の品質を3倍の検証手法を用いて検証する。
まず、適切な雑音周波数を付加することで、実際の単一セル機能の追加により得られる類似度指標の改善の87%が得られることを示す。
次に,合成画像がチューリング試験に合格することを示す。
最後に、これらの合成画像を列車に付加することで、PD-L1セマンティックセグメンテーション性能の点からAIの性能が向上することを示す。
私たちの研究は、アルゴリズムの正確性を改善し、ロバスト性を検証するために、限られたデータセットを偏ることなく、オンデマンドで合成データを生成するためのシンプルで強力なアプローチを提案しています。
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