論文の概要: Graphical Dirichlet Process for Clustering Non-Exchangeable Grouped Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2302.09111v2
- Date: Mon, 31 Jul 2023 21:38:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-02 17:57:25.175461
- Title: Graphical Dirichlet Process for Clustering Non-Exchangeable Grouped Data
- Title(参考訳): 非交換型グループデータのクラスタリングのためのグラフィカルディリクレプロセス
- Authors: Arhit Chakrabarti, Yang Ni, Ellen Ruth A. Morris, Michael L. Salinas,
Robert S. Chapkin, Bani K. Mallick
- Abstract要約: 我々は、依存が既知の有向非巡回グラフによって特徴づけられる可能性のある、交換不能なグループをクラスタリングする問題を考える。
我々は、依存する群固有のランダム測度を共同でモデル化する、グラフィカルディリクレ法と呼ばれるベイズ的非パラメトリックアプローチを提案する。
我々は,効率的な後部推論アルゴリズムを開発し,シミュレーションと実グループ単一セルデータセットを用いてモデルを説明する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.436632973105494
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We consider the problem of clustering grouped data with possibly
non-exchangeable groups whose dependencies can be characterized by a known
directed acyclic graph. To allow the sharing of clusters among the
non-exchangeable groups, we propose a Bayesian nonparametric approach, termed
graphical Dirichlet process, that jointly models the dependent group-specific
random measures by assuming each random measure to be distributed as a
Dirichlet process whose concentration parameter and base probability measure
depend on those of its parent groups. The resulting joint stochastic process
respects the Markov property of the directed acyclic graph that links the
groups. We characterize the graphical Dirichlet process using a novel
hypergraph representation as well as the stick-breaking representation, the
restaurant-type representation, and the representation as a limit of a finite
mixture model. We develop an efficient posterior inference algorithm and
illustrate our model with simulations and a real grouped single-cell dataset.
- Abstract(参考訳): 既知有向非巡回グラフを特徴とする非交換可能群でグループ化データをクラスタリングする問題を考える。
非交換可能群間のクラスターの共有を可能にするために、各ランダム測度を、濃度パラメータとベース確率測度が親群のそれに依存するディリクレ過程として分散することを前提として、依存群特異的なランダム測度を共同でモデル化するベイズ非パラメトリック手法を提案する。
結果の合同確率過程は、群を連結する有向非巡回グラフのマルコフの性質を尊重する。
我々は,新しいハイパーグラフ表現と,棒打ち表現,レストラン型表現,有限混合モデルの極限としての表現を用いて,グラフィカルなディリクレ過程を特徴付ける。
我々は,効率的な後部推論アルゴリズムを開発し,シミュレーションと実グループ単一セルデータセットを用いてモデルを説明する。
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