論文の概要: Synthetic ECG Signal Generation using Probabilistic Diffusion Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.02475v1
- Date: Sat, 4 Mar 2023 18:24:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-07 19:19:21.996652
- Title: Synthetic ECG Signal Generation using Probabilistic Diffusion Models
- Title(参考訳): 確率的拡散モデルを用いた合成ECG信号生成
- Authors: Edmond Adib, Amanda Fernandez, Fatemeh Afghah and John Jeff Prevost
- Abstract要約: 本研究では,改良DDPMとWGANGPモデルを用いたWasserstein GANにより合成ECG信号を生成する。
その結果,提案したパイプラインでは,WGAN-GPモデルの方がDDPMよりもはるかに優れていることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.961725557610508
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep learning image processing models have had remarkable success in recent
years in generating high quality images. Particularly, the Improved Denoising
Diffusion Probabilistic Models (DDPM) have shown superiority in image quality
to the state-of-the-art generative models, which motivated us to investigate
its capability in generation of the synthetic electrocardiogram (ECG) signals.
In this work, synthetic ECG signals are generated by the Improved DDPM and by
the Wasserstein GAN with Gradient Penalty (WGANGP) models and then compared. To
this end, we devise a pipeline to utilize DDPM in its original 2D form. First,
the 1D ECG time series data are embedded into the 2D space, for which we
employed the Gramian Angular Summation/Difference Fields (GASF/GADF) as well as
Markov Transition Fields (MTF) to generate three 2D matrices from each ECG time
series that, which when put together, form a 3-channel 2D datum. Then 2D DDPM
is used to generate 2D 3-channel synthetic ECG images. The 1D ECG signals are
created by de-embedding the 2D generated image files back into the 1D space.
This work focuses on unconditional models and the generation of only Normal ECG
signals, where the Normal class from the MIT BIH Arrhythmia dataset is used as
the training phase. The quality, distribution, and the authenticity of the
generated ECG signals by each model are compared. Our results show that, in the
proposed pipeline, the WGAN-GP model is superior to DDPM by far in all the
considered metrics consistently.
- Abstract(参考訳): ディープラーニング画像処理モデルは,近年,高品質な画像生成において顕著な成功を収めている。
特に, 改良型脱ノイズ拡散確率モデル (DDPM) では, 画像品質が最先端生成モデルよりも優れており, 合成心電図(ECG)信号の生成能力について検討する動機となった。
本研究では,改良ddpmおよび勾配ペナルティ(wgangp)モデルを用いたwasserstein ganにより合成心電図信号を生成し,比較する。
この目的のために、DDPMを元の2D形式で利用するパイプラインを考案した。
まず, 1次元ecg時系列データを2次元空間に埋め込み, グラミアン角和・差分場 (gasf/gadf) とマルコフ遷移場 (mtf) を用いて各ecg時系列から3つの2次元行列を生成し, 3チャンネルの2次元ダムを形成する。
次に、2D DDPMを用いて2D3チャネル合成ECG画像を生成する。
1D ECG信号は、2D生成したイメージファイルを1D空間に再埋め込みすることで生成される。
本研究は,mit bih arrhythmiaデータセットからの正規クラスをトレーニングフェーズとして使用する非条件モデルと正常心電図信号のみの生成に焦点を当てている。
各モデルによる生成したECG信号の品質,分布,信頼性を比較した。
その結果,提案したパイプラインでは,WGAN-GPモデルの方がDDPMよりもはるかに優れていることがわかった。
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