論文の概要: Interpretable machine learning for time-to-event prediction in medicine and healthcare
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.09817v2
- Date: Wed, 27 Mar 2024 16:52:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-28 23:31:58.753512
- Title: Interpretable machine learning for time-to-event prediction in medicine and healthcare
- Title(参考訳): 医療・医療における時間-時間予測のための解釈型機械学習
- Authors: Hubert Baniecki, Bartlomiej Sobieski, Patryk Szatkowski, Przemyslaw Bombinski, Przemyslaw Biecek,
- Abstract要約: 時間依存的な特徴効果とグローバルな特徴重大説明を導入する。
我々は、ポストホックな解釈手法が、滞在期間を予測するAIシステムのバイアスを見つけるのにどのように役立つかを示す。
我々は,がんの生存率を予測性能を超えて評価し,マルチオミクスの特徴群の重要性を考察した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.416913210816592
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Time-to-event prediction, e.g. cancer survival analysis or hospital length of stay, is a highly prominent machine learning task in medical and healthcare applications. However, only a few interpretable machine learning methods comply with its challenges. To facilitate a comprehensive explanatory analysis of survival models, we formally introduce time-dependent feature effects and global feature importance explanations. We show how post-hoc interpretation methods allow for finding biases in AI systems predicting length of stay using a novel multi-modal dataset created from 1235 X-ray images with textual radiology reports annotated by human experts. Moreover, we evaluate cancer survival models beyond predictive performance to include the importance of multi-omics feature groups based on a large-scale benchmark comprising 11 datasets from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Model developers can use the proposed methods to debug and improve machine learning algorithms, while physicians can discover disease biomarkers and assess their significance. We hope the contributed open data and code resources facilitate future work in the emerging research direction of explainable survival analysis.
- Abstract(参考訳): タイム・ツー・イベント予測(Time-to-event prediction)、例えば、がん生存率分析(英語版)または入院期間分析(英語版)は、医療および医療応用において非常に顕著な機械学習タスクである。
しかし、いくつかの解釈可能な機械学習手法がその課題に適合する。
生存モデルの包括的な説明的分析を容易にするため,時間依存的特徴効果とグローバルな特徴重要説明を導入する。
本稿では,1235のX線画像から生成した新しいマルチモーダルデータセットと,人間の専門家が注釈を付けたテキストラジオグラフィーレポートを用いて,AIシステム内のバイアスを検出する方法を示す。
さらに,The Cancer Genome Atlas (TCGA)の11データセットからなる大規模ベンチマークに基づいて,癌生存モデルの評価を行い,マルチオミクスの特徴群の重要性を考察した。
モデル開発者は、提案された手法を使用して機械学習アルゴリズムのデバッグと改善を行うことができ、医師は病気のバイオマーカーを発見し、その重要性を評価することができる。
我々は、貢献したオープンデータとコードリソースが、説明可能な生存分析の新たな研究方向における将来の作業を促進することを願っている。
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