論文の概要: HDformer: A Higher Dimensional Transformer for Diabetes Detection Utilizing Long Range Vascular Signals

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.11340v1
• Date: Fri, 17 Mar 2023 14:11:14 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-03-22 17:54:26.007998
• Title: HDformer: A Higher Dimensional Transformer for Diabetes Detection Utilizing Long Range Vascular Signals
• Title（参考訳）: HDformer:長距離血管信号を利用した糖尿病検出用高次元トランス
• Authors: Ella Lan
• Abstract要約: 本稿では,高次元変換器(HDformer, Higher dimensional Transformer, Higher dimensional Transformer)を新たに提案する。 HDformerは、標準MIMICIIIデータセットにおける最先端の性能(感度98.4、精度97.3、特異度92.8、AUC0.929)をもたらす。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
• License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
• Abstract: Diabetes mellitus is a worldwide concern, and early detection can help to prevent serious complications. Low-cost, non-invasive detection methods, which take cardiovascular signals into deep learning models, have emerged. However, limited accuracy constrains their clinical usage. In this paper, we present a new Transformer-based architecture, Higher Dimensional Transformer (HDformer), which takes long-range photoplethysmography (PPG) signals to detect diabetes. The long-range PPG contains broader and deeper signal contextual information compared to the less-than-one-minute PPG signals commonly utilized in existing research. To increase the capability and efficiency of processing the long range data, we propose a new attention module Time Square Attention (TSA), reducing the volume of the tokens by more than 10x, while retaining the local/global dependencies. It converts the 1-dimensional inputs into 2-dimensional representations and groups adjacent points into a single 2D token, using the 2D Transformer models as the backbone of the encoder. It generates the dynamic patch sizes into a gated mixture-of-experts (MoE) network as decoder, which optimizes the learning on different attention areas. Extensive experimentations show that HDformer results in the state-of-the-art performance (sensitivity 98.4, accuracy 97.3, specificity 92.8, and AUC 0.929) on the standard MIMIC-III dataset, surpassing existing studies. This work is the first time to take long-range, non-invasive PPG signals via Transformer for diabetes detection, achieving a more scalable and convenient solution compared to traditional invasive approaches. The proposed HDformer can also be scaled to analyze general long-range biomedical waveforms. A wearable prototype finger-ring is designed as a proof of concept.
• Abstract（参考訳）: 糖尿病は世界中で懸念されており、早期発見は深刻な合併症の予防に役立つ。 心臓血管信号を深層学習モデルに取り入れる低コストで非侵襲的な検出法が登場している。 しかし、精度の制限は臨床使用を制限している。 本稿では,新しいトランスフォーマーアーキテクチャであるhigher dimensional transformer (hdformer) を提案する。 長距離ppgは、既存の研究で一般的に使用されている1分未満のppg信号と比較して、より広範で深い信号文脈情報を含んでいる。 長範囲データの処理能力と効率を向上させるため,新たに注目モジュールであるTime Square Attention (TSA)を提案し,トークンの容量を10倍以上削減し,局所的/グローバル的依存関係を維持した。 1次元入力を2次元表現に変換し、隣接する点をエンコーダのバックボーンとして2次元トランスフォーマーモデルを用いて単一の2次元トークンに変換する。 動的パッチサイズをデコーダとしてゲート混合(MoE)ネットワークに生成し、異なる注意領域での学習を最適化する。 大規模な実験により、HDformerは標準的なMIMIC-IIIデータセット上での最先端の性能(感度98.4、精度97.3、特異度92.8、AUC 0.929)が既存の研究を上回っていることが示された。 この研究は、糖尿病検出のためのトランスフォーマーを介して長距離非侵襲的なppg信号を初めて取得し、従来の侵襲的アプローチよりもスケーラブルで便利なソリューションを実現する。 提案するhdformerは、一般的な長距離生体医学波形を分析するためにもスケールできる。 ウェアラブルのプロトタイプの指リングは、概念実証として設計されている。

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