論文の概要: Convolutions, Transformers, and their Ensembles for the Segmentation of
Organs at Risk in Radiation Treatment of Cervical Cancer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.11501v1
- Date: Mon, 20 Mar 2023 23:44:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-22 17:06:13.100010
- Title: Convolutions, Transformers, and their Ensembles for the Segmentation of
Organs at Risk in Radiation Treatment of Cervical Cancer
- Title(参考訳): 子宮頸癌放射線治療における臓器の分別のための畳み込み, トランスフォーマー, およびそれらの組合わせ
- Authors: Vangelis Kostoulas, Peter A.N. Bosman, and Tanja Alderliesten
- Abstract要約: 子宮頸癌の放射線治療におけるOAR(Organs At Risk)のセグメンテーションの課題に答える。
我々は、異なるアーキテクチャに属するいくつかの最先端モデルと、いくつかの最先端モデルの側面を組み合わせたいくつかの新しいモデルを比較した。
モデル予測を可視化し、その出力確率を平均化し、モデル予測間のDice Coefficientを計算する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Segmentation of regions of interest in images of patients, is a crucial step
in many medical procedures. Deep neural networks have proven to be particularly
adept at this task. However, a key question is what type of deep neural network
to choose, and whether making a certain choice makes a difference. In this
work, we will answer this question for the task of segmentation of the Organs
At Risk (OARs) in radiation treatment of cervical cancer (i.e., bladder, bowel,
rectum, sigmoid) in Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans. We compare several
state-of-the-art models belonging to different architecture categories, as well
as a few new models that combine aspects of several state-of-the-art models, to
see if the results one gets are markedly different. We visualize model
predictions, create all possible ensembles of models by averaging their output
probabilities, and calculate the Dice Coefficient between predictions of
models, in order to understand the differences between them and the potential
of possible combinations. The results show that small improvements in metrics
can be achieved by advancing and merging architectures, but the predictions of
the models are quite similar (most models achieve on average more than 0.8 Dice
Coefficient when compared to the outputs of other models). However, the results
from the ensemble experiments indicate that the best results are obtained when
the best performing models from every category of the architectures are
combined.
- Abstract(参考訳): 患者の画像に対する関心領域の分離は多くの医療処置において重要なステップである。
ディープニューラルネットワークはこのタスクに特に適していることが証明されている。
しかし、鍵となる疑問は、どのタイプのディープニューラルネットワークを選ぶべきか、特定の選択をするかどうかだ。
本研究では, 頚部癌(膀胱, 腸, 直腸, sigmoid)のMRI検査における放射線治療におけるOAR(Organs At Risk)のセグメンテーションの課題について, この問いに答える。
異なるアーキテクチャカテゴリに属する最先端のモデルと、いくつかの最先端のモデルの側面を組み合わせたいくつかの新しいモデルを比較して、結果が著しく異なるかどうかを確認した。
モデルの予測を可視化し,出力確率を平均化し,モデルの全ての可能なアンサンブルを作成し,モデルの予測間のサイス係数を計算し,それらの違いと可能な組み合わせの可能性を理解する。
結果は、アーキテクチャの進歩とマージによって、メトリクスの小さな改善が達成できることを示しているが、モデルの予測はかなり似ている(ほとんどのモデルは、他のモデルの出力と比較して平均0.8Dice Coefficientで達成される)。
しかし, アンサンブル実験の結果から, アーキテクチャの各カテゴリで最高のモデルが組み合わされた場合に, 最良の結果が得られることが示された。
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