論文の概要: $E(3) \times SO(3)$-Equivariant Networks for Spherical Deconvolution in
Diffusion MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.06103v1
- Date: Wed, 12 Apr 2023 18:37:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-14 16:25:56.708838
- Title: $E(3) \times SO(3)$-Equivariant Networks for Spherical Deconvolution in
Diffusion MRI
- Title(参考訳): 拡散MRIにおける球デコンボリューションのための$E(3) \times SO(3)$-Equivariant Networks
- Authors: Axel Elaldi, Guido Gerig, Neel Dey
- Abstract要約: 本稿では,各ボクセルが球面信号を含むボリュームのスパースデコンボリューションの枠組みを提案する。
この研究は、空間回転、反射、翻訳の対称性に関する同変深層を構成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.726777092009554
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We present Roto-Translation Equivariant Spherical Deconvolution (RT-ESD), an
$E(3)\times SO(3)$ equivariant framework for sparse deconvolution of volumes
where each voxel contains a spherical signal. Such 6D data naturally arises in
diffusion MRI (dMRI), a medical imaging modality widely used to measure
microstructure and structural connectivity. As each dMRI voxel is typically a
mixture of various overlapping structures, there is a need for blind
deconvolution to recover crossing anatomical structures such as white matter
tracts. Existing dMRI work takes either an iterative or deep learning approach
to sparse spherical deconvolution, yet it typically does not account for
relationships between neighboring measurements. This work constructs
equivariant deep learning layers which respect to symmetries of spatial
rotations, reflections, and translations, alongside the symmetries of voxelwise
spherical rotations. As a result, RT-ESD improves on previous work across
several tasks including fiber recovery on the DiSCo dataset,
deconvolution-derived partial volume estimation on real-world \textit{in vivo}
human brain dMRI, and improved downstream reconstruction of fiber tractograms
on the Tractometer dataset. Our implementation is available at
https://github.com/AxelElaldi/e3so3_conv
- Abstract(参考訳): 本稿では,各ボクセルが球面信号を含むボリュームのスパースデコンボリューションのための$E(3)\times SO(3)$$同変フレームワークであるRoto-Translation Equivariant Spherical Deconvolution (RT-ESD)を提案する。
このような6Dデータは拡散MRI(dMRI)において自然に発生する。
それぞれのdMRIボクセルは、通常、様々な重なり合う構造の混合物であるので、白質などの解剖学的構造を復元するためには、ブラインド・デコンボリューションが必要である。
既存のdMRIの作業は、スパース球面のデコンボリューションに反復的あるいは深層学習のアプローチを必要とするが、通常は近隣の計測値の関係を考慮しない。
この研究は、voxelwise球面回転の対称性と共に、空間回転、反射、および変換の対称性に関する同変深層を構成する。
その結果、RT-ESDは、DiSCoデータセット上のファイバリカバリ、現実世界の \textit{in vivo} 人間の脳のdMRIにおけるデコンボリューション由来の部分体積推定、トラクトメーターデータセット上のファイバトラクトグラムの下流再構成の改善など、いくつかのタスクにまたがる以前の作業を改善した。
私たちの実装はhttps://github.com/axelelaldi/e3so3_convで利用可能です。
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