論文の概要: Neural Spherical Harmonics for structurally coherent continuous
representation of diffusion MRI signal
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.08210v2
- Date: Wed, 23 Aug 2023 09:15:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-24 17:39:57.477673
- Title: Neural Spherical Harmonics for structurally coherent continuous
representation of diffusion MRI signal
- Title(参考訳): 拡散MRI信号の構造的コヒーレント連続表現のためのニューラル球高調波
- Authors: Tom Hendriks, Anna Vilanova, Maxime Chamberland
- Abstract要約: 本稿では,ヒト脳の構造的コヒーレンスから恩恵を受ける拡散磁気共鳴画像(dMRI)データセットをモデル化する方法を提案する。
現在の方法では、個々のボクセルのdMRI信号をモデル化し、現在存在するボクセルのコヒーレンスを無視している。
我々は、ニューラルネットワークを用いて、Human Connectome Projectデータセットから1つの対象のdMRI信号を表現するために、球面調和系列をパラメータ化する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.3277163122167433
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present a novel way to model diffusion magnetic resonance imaging (dMRI)
datasets, that benefits from the structural coherence of the human brain while
only using data from a single subject. Current methods model the dMRI signal in
individual voxels, disregarding the intervoxel coherence that is present. We
use a neural network to parameterize a spherical harmonics series (NeSH) to
represent the dMRI signal of a single subject from the Human Connectome Project
dataset, continuous in both the angular and spatial domain. The reconstructed
dMRI signal using this method shows a more structurally coherent representation
of the data. Noise in gradient images is removed and the fiber orientation
distribution functions show a smooth change in direction along a fiber tract.
We showcase how the reconstruction can be used to calculate mean diffusivity,
fractional anisotropy, and total apparent fiber density. These results can be
achieved with a single model architecture, tuning only one hyperparameter. In
this paper we also demonstrate how upsampling in both the angular and spatial
domain yields reconstructions that are on par or better than existing methods.
- Abstract(参考訳): 本研究では,拡散磁気共鳴画像(dMRI)データセットをモデル化する新しい手法を提案する。
現在の方法は個々のボクセルにおけるdmri信号をモデル化し、ボクセル間のコヒーレンスを無視する。
我々は,ニューラルネットワークを用いて球面調和系(NeSH)をパラメータ化し,角領域と空間領域の両方で連続するHuman Connectome Projectデータセットから単一対象のdMRI信号を表現する。
この方法で再構成されたdmri信号は、より構造的にコヒーレントなデータの表現を示す。
傾斜画像中のノイズを除去し、繊維配向分布関数は繊維路に沿った方向の滑らかな変化を示す。
本稿では, 平均拡散率, 分数異方性, および全繊維密度を計算するために, 再構成をどのように利用できるかを紹介する。
これらの結果は単一のモデルアーキテクチャで実現でき、1つのハイパーパラメータのみをチューニングできる。
本稿では, 角領域と空間領域の両方におけるアップサンプリングが, 既存手法と同等以上の再現性をもたらすことを示す。
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