論文の概要: An Instance Segmentation Dataset of Yeast Cells in Microstructures

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.07597v2
• Date: Sun, 23 Apr 2023 11:30:29 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-04-25 20:11:35.522691
• Title: An Instance Segmentation Dataset of Yeast Cells in Microstructures
• Title（参考訳）: 微細組織中の酵母細胞のインスタンスセグメンテーションデータセット
• Authors: Christoph Reich, Tim Prangemeier, Andr\'e O. Fran\c{c}ani, Heinz Koeppl
• Abstract要約: 本稿では, 酵母細胞を微細構造にセグメント化するための新しいデータセットを提案する。 計493枚の濃密な注釈付き顕微鏡像を公表した。 データセットと評価戦略の目的は,新しい細胞セグメンテーション手法の開発を容易にすることである。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 19.76675556520657
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Extracting single-cell information from microscopy data requires accurate instance-wise segmentations. Obtaining pixel-wise segmentations from microscopy imagery remains a challenging task, especially with the added complexity of microstructured environments. This paper presents a novel dataset for segmenting yeast cells in microstructures. We offer pixel-wise instance segmentation labels for both cells and trap microstructures. In total, we release 493 densely annotated microscopy images. To facilitate a unified comparison between novel segmentation algorithms, we propose a standardized evaluation strategy for our dataset. The aim of the dataset and evaluation strategy is to facilitate the development of new cell segmentation approaches. The dataset is publicly available at https://christophreich1996.github.io/yeast_in_microstructures_dataset/ .
• Abstract（参考訳）: 顕微鏡データから単一セル情報を抽出するには、正確なインスタンスワイドセグメンテーションが必要である。 顕微鏡画像からのピクセル単位のセグメンテーションは、特に微構造環境の複雑さが増すと、依然として困難な課題である。 本稿では酵母細胞を微構造に分割する新しいデータセットを提案する。 ピクセル単位のインスタンスセグメンテーションラベルをセルとトラップマイクロ構造の両方に提供します。 総計493枚の密注釈顕微鏡画像を公開する。 本稿では,新しいセグメンテーションアルゴリズムの統一的な比較を容易にするために,データセットの標準化評価戦略を提案する。 データセットと評価戦略の目的は、新しい細胞分割アプローチの開発を促進することである。 データセットはhttps://christophreich 1996.github.io/yeast_in_microstructures_dataset/で公開されている。

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