論文の概要: DeformableFormer: Classification of Endoscopic Ultrasound Guided Fine
Needle Biopsy in Pancreatic Diseases
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.10791v1
- Date: Fri, 21 Apr 2023 07:54:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-24 15:30:35.278421
- Title: DeformableFormer: Classification of Endoscopic Ultrasound Guided Fine
Needle Biopsy in Pancreatic Diseases
- Title(参考訳): DeformableFormer:膵疾患における内視鏡的超音波ガイド下針生検の分類
- Authors: Taiji Kurami, Takuya Ishikawa, Kazuhiro Hotta
- Abstract要約: 膵癌検査にはEUS-FNA(endoscopic Ultrasound-Fine Needle Aspiration)が用いられる。
EUS-FNAは、EUSを用いて腫瘍に細い針を挿入し、膵組織断片を採取する検査である。
膵組織断片は、膵癌かどうかを分類するために染色される。
本研究の目的は,不確定画像から検査可能か否かを分類し,専門医による視覚的分類の精度を超過することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 8.35780131268962
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Endoscopic Ultrasound-Fine Needle Aspiration (EUS-FNA) is used to examine
pancreatic cancer. EUS-FNA is an examination using EUS to insert a thin needle
into the tumor and collect pancreatic tissue fragments. Then collected
pancreatic tissue fragments are then stained to classify whether they are
pancreatic cancer. However, staining and visual inspection are time consuming.
In addition, if the pancreatic tissue fragment cannot be examined after
staining, the collection must be done again on the other day. Therefore, our
purpose is to classify from an unstained image whether it is available for
examination or not, and to exceed the accuracy of visual classification by
specialist physicians. Image classification before staining can reduce the time
required for staining and the burden of patients. However, the images of
pancreatic tissue fragments used in this study cannot be successfully
classified by processing the entire image because the pancreatic tissue
fragments are only a part of the image. Therefore, we propose a
DeformableFormer that uses Deformable Convolution in MetaFormer framework. The
architecture consists of a generalized model of the Vision Transformer, and we
use Deformable Convolution in the TokenMixer part. In contrast to existing
approaches, our proposed DeformableFormer is possible to perform feature
extraction more locally and dynamically by Deformable Convolution. Therefore,
it is possible to perform suitable feature extraction for classifying target.
To evaluate our method, we classify two categories of pancreatic tissue
fragments; available and unavailable for examination. We demonstrated that our
method outperformed the accuracy by specialist physicians and conventional
methods.
- Abstract(参考訳): 膵癌検査にはEUS-FNA(endoscopic Ultrasound-Fine Needle Aspiration)が用いられる。
EUS-FNAは、EUSを用いて腫瘍に薄い針を挿入し、膵組織断片を採取する検査である。
その後、収集された膵組織断片を染色して膵癌かどうかを分類する。
しかし、染色と視覚検査は時間がかかる。
また, 染色後の膵組織破片の検査ができない場合は, その間, 回収を再開しなければならない。
そこで,本研究の目的は,検査可能か否かに関わらず画像から分類し,専門医による視覚的分類の精度を超過することである。
染色前の画像分類は、染色に要する時間と患者の負担を軽減することができる。
しかし,本研究で用いた膵組織断片の像は,膵組織断片は画像の一部に過ぎず,全体像を処理して分類することは不可能である。
そこで我々は,MetaFormerフレームワークでDeformable Convolutionを利用するDeformableFormerを提案する。
アーキテクチャは vision transformer の一般化モデルで構成されており、tokenmixer で変形可能な畳み込みを使用する。
既存のアプローチとは対照的に,提案したDeformableFormerは,Deformable Convolutionによってより局所的かつ動的に機能抽出を行うことができる。
したがって、ターゲットの分類に適した特徴抽出を行うことができる。
本手法を評価するために,膵組織フラグメントの2つのカテゴリを分類した。
本手法は,専門医や従来手法の精度に優れていた。
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