論文の概要: FUSegNet: A Deep Convolutional Neural Network for Foot Ulcer
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.02961v2
- Date: Sat, 27 Jan 2024 03:16:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-30 22:55:37.381474
- Title: FUSegNet: A Deep Convolutional Neural Network for Foot Ulcer
Segmentation
- Title(参考訳): FUSegNet:足の潰瘍分離のための深部畳み込みニューラルネットワーク
- Authors: Mrinal Kanti Dhar, Taiyu Zhang, Yash Patel, Sandeep Gopalakrishnan,
and Zeyun Yu
- Abstract要約: FUSegNetは糖尿病患者の足部潰瘍分節の新しいモデルである。
トレーニング済みのEfficientNet-b7をバックボーンとして使用し、限られたトレーニングサンプルの問題に対処する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.880691536038042
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: This paper presents FUSegNet, a new model for foot ulcer segmentation in
diabetes patients, which uses the pre-trained EfficientNet-b7 as a backbone to
address the issue of limited training samples. A modified spatial and channel
squeeze-and-excitation (scSE) module called parallel scSE or P-scSE is proposed
that combines additive and max-out scSE. A new arrangement is introduced for
the module by fusing it in the middle of each decoder stage. As the top decoder
stage carries a limited number of feature maps, max-out scSE is bypassed there
to form a shorted P-scSE. A set of augmentations, comprising geometric,
morphological, and intensity-based augmentations, is applied before feeding the
data into the network. The proposed model is first evaluated on a publicly
available chronic wound dataset where it achieves a data-based dice score of
92.70%, which is the highest score among the reported approaches. The model
outperforms other scSE-based UNet models in terms of Pratt's figure of merits
(PFOM) scores in most categories, which evaluates the accuracy of edge
localization. The model is then tested in the MICCAI 2021 FUSeg challenge,
where a variation of FUSegNet called x-FUSegNet is submitted. The x-FUSegNet
model, which takes the average of outputs obtained by FUSegNet using 5-fold
cross-validation, achieves a dice score of 89.23%, placing it at the top of the
FUSeg Challenge leaderboard. The source code for the model is available on
https://github.com/mrinal054/FUSegNet.
- Abstract(参考訳): 本稿では,糖尿病患者の足部潰瘍分節の新しいモデルであるFUSegNetについて述べる。
並列scSE(英語版)またはP-scSE(英語版)と呼ばれる空間的およびチャネル的圧縮・励起(scSE)モジュールが加法と最大出力scSEを組み合わせて提案されている。
モジュールをデコーダステージの中央にフレッシュすることで、新しいアレンジが導入された。
上位デコーダのステージは限られた数の特徴写像を持ち、最大出力の scSE をバイパスして P-scSE を短くする。
ネットワークにデータを供給する前に、幾何学的、形態的、強度に基づく拡張を含む一連の拡張を施す。
提案手法は, 報告されたアプローチの中で最も高い92.70%のダイススコアを達成し, 一般に公開されている慢性創傷データセットで評価した。
このモデルは、他のScSEベースのUNetモデルよりも多くのカテゴリにおいてプラットの有益度(PFOM)のスコアで優れており、エッジローカライゼーションの精度を評価する。
このモデルはMICCAI 2021 FUSegチャレンジでテストされ、x-FUSegNetと呼ばれるFUSegNetのバリエーションが提出される。
x-FUSegNetモデルは、FUSegNetが5倍のクロスバリデーションを用いて得た出力の平均値を取り、89.23%のダイススコアを達成し、FUSeg Challengeのリーダーボードの上位に位置する。
このモデルのソースコードはhttps://github.com/mrinal054/FUSegNetで入手できる。
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