論文の概要: Predicting COVID-19 pandemic by spatio-temporal graph neural networks: A
New Zealand's study
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.07731v1
- Date: Fri, 12 May 2023 19:00:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-16 20:08:41.314322
- Title: Predicting COVID-19 pandemic by spatio-temporal graph neural networks: A
New Zealand's study
- Title(参考訳): 時空間グラフニューラルネットワークによる新型コロナウイルスのパンデミック予測 : ニュージーランドの研究
- Authors: Viet Bach Nguyen, Truong Son Hy, Long Tran-Thanh, Nhung Nghiem
- Abstract要約: 我々は,ATMGNN(Attention-based Multi resolution Graph Neural Networks)という新しいディープラーニングアーキテクチャを提案する。
本手法は,空間グラフのマルチスケール構造を学習からクラスタ化アルゴリズムにより,データ駆動方式でキャプチャすることができる。
今後は、リアルタイムの予測とグローバルスケールに向けた作業の拡充を予定しています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.3773496061049
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modeling and simulations of pandemic dynamics play an essential role in
understanding and addressing the spreading of highly infectious diseases such
as COVID-19. In this work, we propose a novel deep learning architecture named
Attention-based Multiresolution Graph Neural Networks (ATMGNN) that learns to
combine the spatial graph information, i.e. geographical data, with the
temporal information, i.e. timeseries data of number of COVID-19 cases, to
predict the future dynamics of the pandemic. The key innovation is that our
method can capture the multiscale structures of the spatial graph via a
learning to cluster algorithm in a data-driven manner. This allows our
architecture to learn to pick up either local or global signals of a pandemic,
and model both the long-range spatial and temporal dependencies. Importantly,
we collected and assembled a new dataset for New Zealand. We established a
comprehensive benchmark of statistical methods, temporal architectures, graph
neural networks along with our spatio-temporal model. We also incorporated
socioeconomic cross-sectional data to further enhance our prediction. Our
proposed model have shown highly robust predictions and outperformed all other
baselines in various metrics for our new dataset of New Zealand along with
existing datasets of England, France, Italy and Spain. For a future work, we
plan to extend our work for real-time prediction and global scale. Our data and
source code are publicly available at https://github.com/HySonLab/pandemic_tgnn
- Abstract(参考訳): パンデミックのダイナミクスのモデル化とシミュレーションは、新型コロナウイルスなどの高感染症の拡散の理解と解決に不可欠である。
本研究では,空間グラフ情報,すなわち地理的データと時間的情報,すなわち新型コロナウイルス感染者数の時系列データを組み合わせて,パンデミックの将来のダイナミクスを予測することを目的として,ATMGNN(Attention-based Multi resolution Graph Neural Networks)という新しいディープラーニングアーキテクチャを提案する。
鍵となる革新は,本手法が空間グラフのマルチスケール構造を学習からクラスタアルゴリズムにより,データ駆動方式で捉えることができる点である。
これにより、私たちのアーキテクチャは、パンデミックのローカルまたはグローバルシグナルをピックアップし、長距離の空間的および時間的依存性の両方をモデル化することを学びます。
重要なことに、ニュージーランド向けの新しいデータセットを収集し、組み立てました。
我々は時空間モデルとともに統計手法、時間的アーキテクチャ、グラフニューラルネットワークの包括的なベンチマークを構築した。
また,社会経済横断データを導入し,予測をさらに強化した。
提案モデルでは,イギリス,フランス,イタリア,スペインの既存のデータセットとともに,ニュージーランドの新しいデータセットのさまざまな指標において,非常に堅牢な予測結果を示し,その他のベースラインを上回りました。
将来的には、リアルタイム予測とグローバルスケールのための作業を拡大する予定です。
私たちのデータとソースコードはhttps://github.com/HySonLab/pandemic_tgnnで公開されています。
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