論文の概要: Dynamic Structural Brain Network Construction by Hierarchical Prototype
Embedding GCN using T1-MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.10077v1
- Date: Wed, 17 May 2023 09:22:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-18 16:47:53.091698
- Title: Dynamic Structural Brain Network Construction by Hierarchical Prototype
Embedding GCN using T1-MRI
- Title(参考訳): T1-MRIを用いた階層型プロトタイプ埋め込みGCNによる動的構造脳ネットワークの構築
- Authors: Yilin Leng, Wenju Cui, Chen Bai, Zheng Yanyan, Jian Zheng
- Abstract要約: T1-MRIに基づく新しい動的構造脳ネットワーク構築法を提案する。
まず、空間的関連チャネルをクラスタリングし、いくつかの重要な脳領域をプロトタイプとして生成する。
本稿では, 階層型脳意味構造を潜在空間に組み込むプロトタイプの分布を制限するために, 対照的な損失関数を導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.1580450836713574
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Constructing structural brain networks using T1-weighted magnetic resonance
imaging (T1-MRI) presents a significant challenge due to the lack of direct
regional connectivity information. Current methods with T1-MRI rely on
predefined regions or isolated pretrained location modules to obtain atrophic
regions, which neglects individual specificity. Besides, existing methods
capture global structural context only on the whole-image-level, which weaken
correlation between regions and the hierarchical distribution nature of brain
connectivity.We hereby propose a novel dynamic structural brain network
construction method based on T1-MRI, which can dynamically localize critical
regions and constrain the hierarchical distribution among them for constructing
dynamic structural brain network. Specifically, we first cluster
spatially-correlated channel and generate several critical brain regions as
prototypes. Further, we introduce a contrastive loss function to constrain the
prototypes distribution, which embed the hierarchical brain semantic structure
into the latent space. Self-attention and GCN are then used to dynamically
construct hierarchical correlations of critical regions for brain network and
explore the correlation, respectively. Our method is evaluated on ADNI-1 and
ADNI-2 databases for mild cognitive impairment (MCI) conversion prediction, and
acheive the state-of-the-art (SOTA) performance. Our source code is available
at http://github.com/*******.
- Abstract(参考訳): T1強調磁気共鳴画像(T1-MRI)を用いた構造脳ネットワークの構築は、直接の地域接続情報がないために大きな課題となる。
t1-mriの現在の手法は、個別の特異性を無視する萎縮性領域を得るために、事前定義された領域または分離された事前訓練された位置モジュールに依存している。
さらに,本研究では,T1-MRIに基づく新しい動的構造脳ネットワーク構築手法を提案する。これにより,重要な領域を動的に局所化し,それらの階層分布を制約し,動的構造脳ネットワークを構築することができる。
具体的には,まず空間相関チャネルをクラスタ化し,いくつかの重要な脳領域をプロトタイプとして生成する。
さらに,階層型脳意味構造を潜在空間に組み込むプロトタイプの分布を制限するために,対照的な損失関数を導入する。
次に、自己注意とGCNを使用して、脳ネットワークの臨界領域の階層的相関を動的に構築し、相関を探索する。
本手法は, 軽度認知障害 (MCI) 変換予測のためのADNI-1 と ADNI-2 データベースを用いて評価し, 最先端 (SOTA) の性能向上を図る。
ソースコードはhttp://github.com/*******で公開されています。
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