論文の概要: Predicting Side Effect of Drug Molecules using Recurrent Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.10473v1
- Date: Wed, 17 May 2023 16:56:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-19 18:36:05.570621
- Title: Predicting Side Effect of Drug Molecules using Recurrent Neural Networks
- Title(参考訳): リカレントニューラルネットワークを用いた薬物分子の副作用予測
- Authors: Collin Beaudoin, Koustubh Phalak, Swaroop Ghosh
- Abstract要約: 規制団体への提出前に副作用の特定に失敗すると、企業への追加調査に数百万ドルと数ヶ月かかる可能性がある。
従来のアプローチでは、サイドエフェクト予測のための複雑なモデル設計と過剰なパラメータカウントに依存していた。
本稿では,単純なニューラルネットワーク,特にリカレントニューラルネットワークの利用を可能にするアプローチを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.608607664709314
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Identification and verification of molecular properties such as side effects
is one of the most important and time-consuming steps in the process of
molecule synthesis. For example, failure to identify side effects before
submission to regulatory groups can cost millions of dollars and months of
additional research to the companies. Failure to identify side effects during
the regulatory review can also cost lives. The complexity and expense of this
task have made it a candidate for a machine learning-based solution. Prior
approaches rely on complex model designs and excessive parameter counts for
side effect predictions. We believe reliance on complex models only shifts the
difficulty away from chemists rather than alleviating the issue. Implementing
large models is also expensive without prior access to high-performance
computers. We propose a heuristic approach that allows for the utilization of
simple neural networks, specifically the recurrent neural network, with a 98+%
reduction in the number of required parameters compared to available large
language models while still obtaining near identical results as top-performing
models.
- Abstract(参考訳): サイドエフェクトなどの分子特性の同定と検証は、分子合成の過程において最も重要かつ時間を要するステップの1つである。
例えば、規制団体への提出前に副作用を特定できない場合、企業への追加調査に数百万ドルと数ヶ月かかる可能性がある。
規制審査中の副作用の特定に失敗しても命がかからない。
このタスクの複雑さとコストにより、機械学習ベースのソリューションの候補となった。
事前のアプローチは、副作用予測のために複雑なモデル設計と過剰なパラメータ数に依存する。
複雑なモデルへの依存は、問題を緩和するよりも、化学者から困難を逸脱させるだけだと信じています。
大型モデルの実装も、高性能コンピュータに事前アクセスすることなく高価である。
本稿では,単純なニューラルネットワーク,特にリカレントニューラルネットワークの利用を可能にするヒューリスティックなアプローチを提案する。
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