論文の概要: PathAsst: Redefining Pathology through Generative Foundation AI
Assistant for Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2305.15072v1
- Date: Wed, 24 May 2023 11:55:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-25 16:18:56.274641
- Title: PathAsst: Redefining Pathology through Generative Foundation AI
Assistant for Pathology
- Title(参考訳): PathAsst: ジェネレーティブファウンデーションAIアシスタントによる病理の再定義
- Authors: Yuxuan Sun, Chenglu Zhu, Sunyi Zheng, Kai Zhang, Zhongyi Shui,
Xiaoxuan Yu, Yizhi Zhao, Honglin Li, Yunlong Zhang, Ruojia Zhao, Xinheng Lyu,
Lin Yang
- Abstract要約: PathAsstは、病理学における診断と予測分析に革命をもたらすための、生成ファンデーションAIアシスタントである。
我々は、PubMed、総合的な病理教科書、信頼できる病理ウェブサイト、病理学者による注釈付き個人データなど、様々な信頼できる情報源から、142万以上の高品質な病理画像テキストペアを収集した。
私たちのPathAsstは、CLIPビジョンエンコーダと協調して、Vicuna-13B言語モデルに基づいて訓練されています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.746172796539089
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: As advances in large language models (LLMs) and multimodal techniques
continue to mature, the development of general-purpose multimodal large
language models (MLLMs) has surged, with significant applications in natural
image interpretation. However, the field of pathology has largely remained
untapped in this regard, despite the growing need for accurate, timely, and
personalized diagnostics. To bridge the gap in pathology MLLMs, we present the
PathAsst in this study, which is a generative foundation AI assistant to
revolutionize diagnostic and predictive analytics in pathology. To develop
PathAsst, we collect over 142K high-quality pathology image-text pairs from a
variety of reliable sources, including PubMed, comprehensive pathology
textbooks, reputable pathology websites, and private data annotated by
pathologists. Leveraging the advanced capabilities of ChatGPT/GPT-4, we
generate over 180K instruction-following samples. Furthermore, we devise
additional instruction-following data, specifically tailored for the invocation
of the pathology-specific models, allowing the PathAsst to effectively interact
with these models based on the input image and user intent, consequently
enhancing the model's diagnostic capabilities. Subsequently, our PathAsst is
trained based on Vicuna-13B language model in coordination with the CLIP vision
encoder. The results of PathAsst show the potential of harnessing the
AI-powered generative foundation model to improve pathology diagnosis and
treatment processes. We are committed to open-sourcing our meticulously curated
dataset, as well as a comprehensive toolkit designed to aid researchers in the
extensive collection and preprocessing of their own datasets. Resources can be
obtained at
https://github.com/superjamessyx/Generative-Foundation-AI-Assistant-for-Pathology.
- Abstract(参考訳): 大規模言語モデル(LLM)やマルチモーダル技術の発展が進み続け、汎用多モーダル大規模言語モデル(MLLM)の開発が進み、自然画像の解釈にも大きな応用がなされている。
しかし、病理学の分野は、正確でタイムリーでパーソナライズされた診断の必要性が高まっているにもかかわらず、この点に関してほとんど解明されていない。
病理学MLLMのギャップを埋めるため,病理学における診断・予測分析に革命をもたらすための生成基盤AIアシスタントであるPathAsstを本研究で紹介する。
pathasstを開発するために,pubmed,comprehensive pathology texts,reputable pathology website,および病理学者による注釈付きプライベートデータなど,さまざまな信頼できる情報源から142k以上の高品質の病理テキストペアを収集した。
ChatGPT/GPT-4の高度な機能を活用し,180K以上の命令追従サンプルを生成する。
さらに,パスタストが入力画像とユーザの意図に基づいて,これらのモデルと効果的に相互作用することを可能にし,モデルの診断能力を向上させることを目的として,追加の命令追従データを考案する。
その後、我々のPathAsstは、CLIPビジョンエンコーダと協調して、Vicuna-13B言語モデルに基づいて訓練される。
PathAsstの結果は、病理診断と治療プロセスを改善するためにAIを活用した生成基盤モデルを活用する可能性を示している。
私たちは、厳格にキュレートされたデータセットと、研究者が自身のデータセットの広範な収集と事前処理を支援するために設計された包括的なツールキットをオープンソース化することを約束しています。
リソースはhttps://github.com/superjamessyx/Generative-Foundation-AI-Assistant-for-Pathologyで取得できる。
関連論文リスト
- Knowledge-enhanced Visual-Language Pretraining for Computational Pathology [68.6831438330526]
本稿では,公共資源から収集した大規模画像テキストペアを利用した視覚的表現学習の課題について考察する。
ヒト32組織から病理診断を必要とする4,718の疾患に対して50,470個の情報属性からなる病理知識ツリーをキュレートする。
すべてのコード、モデル、そして病理知識ツリーは、研究コミュニティにリリースされます。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-04-15T17:11:25Z) - Segmentation, Classification and Interpretation of Breast Cancer Medical Images using Human-in-the-Loop Machine Learning [37.69303106863453]
本論文は、乳癌のゲノムデータと全スライドイメージング(WSI)解析の統合を扱っている。
病理医の関与は, より優れたセグメンテーションモデルの開発と, モデルの説明能力の向上に役立ったが, 分類結果は準最適であった。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-29T10:49:02Z) - Large-scale Long-tailed Disease Diagnosis on Radiology Images [59.37561810438641]
本研究では,放射線画像における大規模大語彙疾患分類の問題点について検討する。
i)データセット構築では、39,026ケース(192,675スキャン)を含む930のユニークなICD-10-CMコードとリンクした5568の障害を含む、学術的にアクセス可能な大規模診断データセットを構築します。
さらに,本研究の最終モデルは事前学習モデルとして機能し,様々な外部データセットの診断に役立てることができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-26T18:20:48Z) - HEALNet -- Hybrid Multi-Modal Fusion for Heterogeneous Biomedical Data [12.109041184519281]
本稿では, フレキシブルなマルチモーダル融合アーキテクチャであるHybrid Early-fusion Attention Learning Network (HEALNet)を提案する。
The Cancer Genome Atlas (TCGA) の4つの癌コホートにおける全スライド画像と多モードデータの多モード生存解析を行った。
HEALNetは最先端のパフォーマンスを実現し、ユニモーダルベースラインと最近のマルチモーダルベースラインの両方を大幅に改善した。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-11-15T17:06:26Z) - Domain-specific optimization and diverse evaluation of self-supervised
models for histopathology [9.450129206898115]
組織学におけるタスク固有の深層学習モデルは、診断、臨床研究、精密医療を改善するための有望な機会を提供する。
自己教師型学習(SSL)による病理組織学の基礎モデルの開発と評価について述べる。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-10-20T03:38:07Z) - PathLDM: Text conditioned Latent Diffusion Model for Histopathology [62.970593674481414]
そこで我々は,高品質な病理像を生成するためのテキスト条件付き遅延拡散モデルPathLDMを紹介した。
提案手法は画像とテキストデータを融合して生成プロセスを強化する。
我々は,TCGA-BRCAデータセット上でのテキスト・ツー・イメージ生成において,SoTA FIDスコア7.64を達成し,FID30.1と最も近いテキスト・コンディショナブル・コンペティタを著しく上回った。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-09-01T22:08:32Z) - Validating polyp and instrument segmentation methods in colonoscopy through Medico 2020 and MedAI 2021 Challenges [58.32937972322058]
メディコオートマチックポリープセグメンテーション(Medico 2020)と「メディコ:医療画像の透明性(MedAI 2021)」コンペティション。
本報告では, それぞれのコントリビューションを包括的に分析し, ベストパフォーマンスメソッドの強さを強調し, クリニックへの臨床翻訳の可能性について考察する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-30T16:08:45Z) - Data and Knowledge Co-driving for Cancer Subtype Classification on
Multi-Scale Histopathological Slides [4.22412600279685]
病理学者のような組織学的スライド上で癌サブタイプ分類の過程を再現するデータ・知識共同運転(D&K)モデルを提案する。
具体的には、データ駆動モジュールにおいて、アンサンブル学習におけるバッグング機構を利用して、埋め込み表現ユニットによって抽出された様々なバッグの組織学的特徴を統合する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-04-18T21:57:37Z) - A multi-stage machine learning model on diagnosis of esophageal
manometry [50.591267188664666]
このフレームワークには、飲み込みレベルにおけるディープラーニングモデルと、学習レベルにおける機能ベースの機械学習モデルが含まれている。
これは、生のマルチスワローデータからHRM研究のCC診断を自動的に予測する最初の人工知能モデルである。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-06-25T20:09:23Z) - Select-ProtoNet: Learning to Select for Few-Shot Disease Subtype
Prediction [55.94378672172967]
本研究は, 類似患者のサブグループを同定し, 数発の疾患のサブタイプ予測問題に焦点を当てた。
新しいモデルを開発するためにメタラーニング技術を導入し、関連する臨床課題から共通の経験や知識を抽出する。
我々の新しいモデルは、単純だが効果的なメタ学習マシンであるPrototypeal Networkと呼ばれる、慎重に設計されたメタラーナーに基づいて構築されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-09-02T02:50:30Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。