論文の概要: Topology-Aware Uncertainty for Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.05671v3
- Date: Mon, 30 Oct 2023 05:08:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-01 23:44:03.236142
- Title: Topology-Aware Uncertainty for Image Segmentation
- Title(参考訳): 画像セグメンテーションにおけるトポロジー認識の不確かさ
- Authors: Saumya Gupta, Yikai Zhang, Xiaoling Hu, Prateek Prasanna and Chao Chen
- Abstract要約: このようなタスクに対する不確実性の推定に重点を置いているので、人間のアノテータが検証できるように、非常に不確実でエラーを起こしやすい構造を特定できる。
本稿では,隣接する構造物を考慮に入れながら構造物の不確かさを推定する共同予測モデルを提案する。
また,各構造に固有の不確かさをモデル化する新しい確率的DMTを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.248891926246383
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Segmentation of curvilinear structures such as vasculature and road networks
is challenging due to relatively weak signals and complex geometry/topology. To
facilitate and accelerate large scale annotation, one has to adopt
semi-automatic approaches such as proofreading by experts. In this work, we
focus on uncertainty estimation for such tasks, so that highly uncertain, and
thus error-prone structures can be identified for human annotators to verify.
Unlike most existing works, which provide pixel-wise uncertainty maps, we
stipulate it is crucial to estimate uncertainty in the units of topological
structures, e.g., small pieces of connections and branches. To achieve this, we
leverage tools from topological data analysis, specifically discrete Morse
theory (DMT), to first capture the structures, and then reason about their
uncertainties. To model the uncertainty, we (1) propose a joint prediction
model that estimates the uncertainty of a structure while taking the
neighboring structures into consideration (inter-structural uncertainty); (2)
propose a novel Probabilistic DMT to model the inherent uncertainty within each
structure (intra-structural uncertainty) by sampling its representations via a
perturb-and-walk scheme. On various 2D and 3D datasets, our method produces
better structure-wise uncertainty maps compared to existing works. Code
available at https://github.com/Saumya-Gupta-26/struct-uncertainty
- Abstract(参考訳): 比較的弱い信号と複雑な幾何学・トポロジーのため, 血管や道路網などの曲線構造のセグメンテーションは困難である。
大規模なアノテーションを容易かつ加速するためには、専門家による証明読取のような半自動的なアプローチを採用する必要がある。
本研究では,このようなタスクに対する不確実性評価に焦点をあて,高い不確かさとエラー発生構造を人間のアノテータが検証できるようにする。
ピクセルワイズ不確実性マップを提供する既存の多くの作品とは異なり、我々は、例えば小さな接続や枝などの位相構造の単位における不確かさを推定することが重要であると規定している。
これを実現するために、我々は、トポロジカルデータ解析、特に離散モース理論(DMT)のツールを活用し、まず構造を捉え、その不確実性を推論する。
この不確かさをモデル化するために,(1)隣接構造物を考慮しながら構造物の不確かさを推定する共同予測モデル(構造間不確実性)を提案し,(2)その表現を摂動・歩行スキームでサンプリングし,各構造物内固有の不確かさをモデル化する新しい確率的dmtを提案する。
様々な2次元および3次元データセットにおいて,本手法は既存手法と比較して構造的不確実性マップを生成する。
コードはhttps://github.com/saumya-gupta-26/struct-uncertaintyで利用可能
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